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基于EST银杏光合作用相关基因表达分析
  • ISSN号:1673-923X
  • 期刊名称:《中南林业科技大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S729.95[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学] Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中南林业科技大学生命科学与技术学院,湖南长沙410004, [2]中南林业科技大学经济林栽培育种国家林业局重点实验室,湖南长沙410004, [3]中南林业科技大学生物环境科学与技术研究所,湖南长沙410004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30471417)
中文摘要:

以银杏雌树成熟叶为材料构建cDNA文库,随机挑取2 324个克隆进行5′端测序,并将所得序列与核酸数据库进行同源性比较。结果显示:银杏叶光合作用基因ESTs为97条,占能量代谢相关的基因ESTs总数的75%;与光反应相关的基因主要有PSII捕光叶绿素a/b结合蛋白、放氧复合体蛋白、质体蓝素(PC)、PSI捕光叶绿素a/b结合蛋白、PSI反应中心亚单位、铁硫蛋白、铁氧蛋白还原酶、ATP合成酶等;与暗反应相关的基因主要有核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶(RuBisCO)、核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶激酶RuBisCO activase(RA)、甘油醛—3—磷酸脱氢酶、核桐糖—5—磷酸异构酶、丙糖磷酸异构酶等;RuBisCO基因表达相当丰富,与落叶松Larix laricinaRuBisCO同源。这些结果为揭示银杏光合作用过程中的基因表达和生理过程提供了科学依据。

英文摘要:

Based on 5′-sequencing of the 2 324 clones from cDNA library of female Gingko mature leaves,a homology comparison the obtained sequence to genes from the GenBank at NCBI was carried out.Analysis of the Ginkgo biloba EST library revealed a number of ESTs with high BLAST similarity to genes with known roles in higher plant photosynthesis process.These genes consisted of those involved in the light-reaction and dark-reaction of the plant photosynthesis,and the ESTs was 97.75% of the total ESTs from energy metabolization.The former was similar to genes related to light harvesting chlorophyll a/b binding protein of photosystem II gene as well as protein of oxygen-evolving complex gene,plastocyanin precursor gene,chlorophyll a/b binding protein of LHCI type II precursor gene,PSI reaction center subunit II,subunit of photosystem I,ferredoxin-NADP oxidoreductase(FNR) and ATP synthase alpha chain etc..The latter had homologies to genes that regulate the dark reaction,including RuBisCO small subunit,RuBisCO activase(RA) gene,glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) gene,ribulose-5-phosphate-3-epimerase gene,and Triosephosphate isomerase(TIM) gene.The expression of RuBisCO gene was quite rich,and most similar to Larix laricina RuBisCO.The findmgs provide a scientific basis for revealing the physilogical process and gene expression in the photosynthetic course of G.biloba.

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期刊信息
  • 《中南林业科技大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:赵运林
  • 地址:湖南长沙市韶山南路498号
  • 邮编:410004
  • 邮箱:xb-csfu@163.com
  • 电话:0731-85623395 85623278
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-923X
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1470/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年被评为全国高优秀学报二等奖,湖南省高校优秀学报一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11201