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牦牛α1-珠蛋白基因的克隆和序列分析
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q953[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学动物科技学院,江苏南京210095, [2]河北省红松洼种畜场,河北承德310034, [3]四川省龙日种畜场,四川红原624400
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30500360)
中文摘要:

根据α-珠蛋白基因起始密码子上游及终止密码子下游的保守序列设计引物,以牦牛基因组DNA为模板克隆并测定了α-珠蛋白基因序列。结果表明,所测的氨基酸序列与牦牛α-珠蛋白链的氨基酸序列完全相同,即为牦牛α1-珠蛋白基因,长706bp,编码141个氨基酸。通过与其他物种的同源性比较,发现牦牛α1-珠蛋白基因的核苷酸序列与黄牛和水牛的同源性分别为99.71%和98.58%,与山羊、绵羊、人和马的同源性只有96.0:3%、95.57%、68.55%和51.13%;氨基酸序列与黄牛和水牛的同源性分别为99.29%和96.45%,与山羊、绵羊、人和马的同源性只有92.90%、91.49%、87.23%和87.23%,说明牛亚科α-珠蛋白基因在进化上高度保守。同时发现第254位的碱基A为牦牛α1-珠蛋白基因所特有。牦牛的两个α1-珠蛋白基因长度相等,都为706bp,且间距为2.47kb,距离比山羊的远。

英文摘要:

The α-globin gene of yak was amplified and cloned by using the primers based on the conserved region of the upstream from the initiation codon and the downstream from the termination codon. The putative amino acid was completely consistent with the known amino acid of yak α1-globin chain, indicating the cloning sequence was yak α1-globin gene with the length of 706 bp coding 141 amino acids. DNA sequence comparison with that of cattle, buffalo, goat, sheep, human, horse suggests the homologies being 99. 71%, 98.58%, 96. 03%, 95.57%, 68. 55% and 51.13% , respectively; and amino acid comparison being 99. 29%, 96. 45%, 92. 90% , 91.49%, 87.23% and 87.23%, respectively. The result of BLAST indicated that the α-globin gene of bovine subfamily was conserved in evolution. The A base at the 254th was the characteristic base of yak α1-globin gene. The two α-globin genes of yak had equivalent length of 706 bp and their intergenic region had the length of 2.47 kb which is farther than that of goat.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558