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牦牛DAZL基因编码区的克隆和序列特征与进化分析
  • ISSN号:1000-2030
  • 期刊名称:《南京农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S823.85[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]南京农业大学动物科技学院,江苏南京210095, [2]南京农业大学信息科技学院,江苏南京210095, [3]中国农业大学农业生物技术国家重点实验室,北京100193
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30500360); 农业生物技术国家重点实验室开放课题(2009SKLAB07-2)
中文摘要:

根据黄牛DAZL基因序列设计引物,通过PCR扩增和克隆测序获得牦牛睾丸组织DAZL基因编码区序列,利用生物信息学软件分析牦牛DAZL基因编码区序列结构以及与其他物种的系统发育关系。结果表明:牦牛DAZL基因cDNA序列长度为1 782 bp,编码区全长885 bp,编码295个氨基酸,与黄牛的氨基酸序列同源性为98.31%;牦牛DAZL蛋白含有DAZ基因家族所具有的典型的RNA结合域和DAZ重复基序。系统发育分析显示:牦牛与黄牛首先聚为一类,然后与哺乳纲的其他物种相聚,而与鱼纲、爬行纲动物的亲缘关系最远。

英文摘要:

Based on the Deleted in Azoospermia-Like(DAZL)gene sequences of cattle,primers were designed to amplify DAZL gene coding region using PCR in testis of yak.The sequence structure of the DAZL gene coding region and the phylogenetic relationship with other species were analyzed by application of the bioinformatics software.The PCR amplification results showed that the sequences were 1 782 base pairs long and the encoding region contained 885 bp encoding 295 amino acid residues.The homologies of the coding region amino acid residues between the yak and cattle were 98.31%.The yak DAZL gene including one typical RNA recognitong motif(RRM)domains and multiple DAZ repeats as in DAZ family.Phylogenetic analysis showed that the yak and the cattle were constructed as the first group,the second was the animals from Mammalia,the last were the Pisces and the Peptiliap.

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期刊信息
  • 《南京农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:郑小波
  • 地址:江苏省南京市卫岗1号
  • 邮编:210095
  • 邮箱:nauxb@njau.edu.cn
  • 电话:025-84395214
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2030
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1148/S
  • 邮发代号:28-53
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国优秀科技期刊,第二届江苏省十佳科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22558