位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
草莓miR390靶基因TAS3的克隆及表达分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:2013.11.26
  • 页码:2153-2158
  • 分类:Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]沈阳农业大学植物保护学院,沈阳110866, [2]沈阳农业大学园艺学院,沈阳110866
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(31101524);中国博士后科学基金(20100481212,2012T50270);辽宁省创新团队项目(LT2010094)
  • 相关项目:草莓miR390与白粉病抗性的关系及表达特性研究
中文摘要:

以栽培草莓品种‘全明星’为试材,通过3,-和5LRACE技术克隆出miR390靶基因TAS3的cDNA全长,命名为FaTAS3。序列分析发现:草莓TAS3基因的cDNA全长为742bp,含有16个碱基的PolyA尾巴及2个高度保守的ta—siRNA产生位点和1个miR390靶位点;该基因DNA全长为824bp,5’端130bp处有一个98bp的内含子序列。生物信息学软件预测显示,草莓TAS3基因的启动子除具有TATA/CAAT—box外,还含有Gbox、C—box等特异作用元件。实时定量RT—PCR结果表明,草莓miR390与靶基因TAS3间的表达模式与拟南芥中的表达模式相同,推测草莓TAS3基因的生物合成也受miR390的指导。

英文摘要:

The miR390-targeted TAS3 gene named FaTAS3 was isolated from strawberry (Fragaria ananassa 'Allstar') with the methods of PCR and RACE. Sequence analysis showed that the cDNA was consisted of a 742 base pair with a 16 bp poly A and highly conserved domains,two ta-siRNA-generating regions and one miR390 complementary site. The full-length DNA of FaTAS3 is 824 bp with an intron sequence of 98 bp at the t30 bp from the 5' end of TAS3 transcript. In addition to the TATA/CAAT-box,its promoter predicted by bioinformatic analyses also contained some specific regulatory elements such as G-box,C-box and etc. The results of real time RT-PCR showed that the expression pattern of miR390 and its targeted TAS3 gene in strawberry is a similar manner to Arabidopsis. So we deduce that the biological formation of strawberry TAS3 gene was also cleaved by miR390.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104