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草莓CO同源基因FaCO-2的克隆及表达分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:华北农学报
  • 时间:2012
  • 页码:1-6
  • 分类:S663.9[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]辽宁省农业科学院蔬菜研究所,沈阳110161, [2]沈阳农业大学园艺学院/设施园艺省部共建教育部重点实验室,沈阳110161
  • 相关基金:辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划项目(LJQ2014069);国家自然科学基金项目(31101524)
  • 相关项目:草莓miR390与白粉病抗性的关系及表达特性研究
中文摘要:

microRNA(miRNA)是来自真核生物自身基因组的非编码小分子RNA,在转录后水平上负调控基因表达,在植物的生长发育和胁迫应答等方面起重要作用.以栽培草莓艳丽为试材,利用RT-PCR 技术克隆草莓叶片中5 种新miRNA 的前体及靶基因,分析靶基因的结构特征与功能,结果表明:草莓miR-6,miR-12,miR-13,miR-14,miR-29 的前体长度分别为513 bp,309 bp,464bp,334 bp 和343 bp,均能形成典型的茎环结构,其中miR-12、miR-13 的成熟miRNA序列在茎环3' 端臂上,miR-6、miR-14、miR-29成熟miRNA序列在茎环的5' 端臂上.miR-14 与miR-29 的靶基因分别为854bp 和690bp,与森林草莓基因组对应序列-致性为98.72%和99.42%,其中miR-29 靶基因是GRP基因,编码143个氨基酸,推测miR-29 靶基因在草莓植株的胁迫响应中有重要调控作用.本研究丰富了草莓miRNA的研究,为揭示草莓miRNA的生物学功能奠定基础.

英文摘要:

microRNAs are small, non-coding RNAs from eukaryotic genomes that act to negatively regulate the expression of theirtarget genes at the post-transcriptional levels, and play important roles in the plant growing development and their response toenvironmental stresses. The precursors of five novel miRNAs and their target genes were cloned by using RT-PCR methods fromleaves of cultivated strawberry, Yanli, and characteristic and function of the targets genes were analyzed. The results showed that theprecursors lengths of miR-6, miR-12, miR-13, miR-14 and miR-29 were 513 bp, 309 bp, 464 bp, 334 bp and 343 bp,respectively. They could form typical stem-loop structure. Among them, the mature miRNAs of miR12 and miR13 located in the 3'end of stem-loop, and the mature miRNAs of miR-6, miR-14 and miR-29 were at the 5' end of stem-loop. The target genes ofmiR-14 and miR-29 were 854bp and 690bp in length, and their identities of sequences were 98.72% and 99.42% comparing withcorresponding sequence in strawberry genome. The target gene of miR-29 was GRP, encoded a predicted protein of 143 amino acidresidues. So we deduce it has the important regulated function in their response to environmental stresses of strawberries. Theresults will enrich the research on strawberry miRNA and lay the foundation of the biological function of strawberry miRNA.

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962