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拮抗细菌DNA的CpG-N ODN筛选
  • ISSN号:0577-7402
  • 期刊名称:《解放军医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R916[医药卫生—药学] R342[医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]第三军医大学基础部药理学教研室,重庆400038, [2]解放军第97医院烧伤科
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30271512)
中文摘要:

目的在抑制性CpG寡核苷酸(CpG-N ODN)分子设计的基础上,选择部分序列加以合成并对其生物学活性进行鉴定,筛选出能够拮抗细菌DNA的CpG-N ODN。方法对合成的10条CpG ODN进行生物学活性的初筛和复筛,观察其自身的刺激性及其对CpG-SODN诱导的TNF-α释放的抑制作用。使用RNAstructure version3.71预测CpG ODN的二级结构及自由能,根据10条CpG ODN构效关系分析结果,对CpG-N ODN分子进行再设计,并从中选择11个序列进行生物活性的筛选。结果首次合成的10条CpG ODN仅1条是对细菌DNA拮抗作用较弱的CpG-N ODN。通过对其构效关系进行分析,推测CpG ODN的生物活性可能与自由能相关。在此基础上对CpG-N ODN分子进行了再设计,合成的11条CpG ODN中有5条是拮抗作用较强的CpG-N ODN。结论获得了6条CpG-N ODN。CpG ODN的生物活性可能与自由能密切相关。

英文摘要:

Objective To obtain a potent bacterial DNA antagonizing CpG oligonucleotides (CpG-N ODN) from the structures of Adv2, 5 DNA. Methods Ten putative CpG-N ODNs were synthesized and investigated. Their abilities to inhibit the TNF-α release from hPBMC were observed. Based on the above results, the putative CpG-N ODN was redesigned according to the relationship between the structure and free energy using RNA structure software (version 3. 71). Eleven putative CpG-N ODNs were synthesized and screened. Results Out of the ten initial CpG ODNs, ODN101 was the only CpG-N ODN with weak activity to inhibit TNF-α release from hPBMC induced by CpG-N ODN. After redesign, five CpG-N ODNs with strong activity were confirmed Conclusion Six CpG-N ODNs were obtained with activity to inhibit TNF-α release from hPBMC induced by CpG-N ODN.

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期刊信息
  • 《解放军医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国人民解放军总后勤部卫生部
  • 主办单位:人民军医出版社
  • 主编:
  • 地址:北京市100036信箱188分箱
  • 邮编:100036
  • 邮箱:mjcpla@pmmp.com.cn
  • 电话:010-51927306
  • 国际标准刊号:ISSN:0577-7402
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1056/R
  • 邮发代号:2-74
  • 获奖情况:
  • 全军医学期刊质量评比优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30614