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2型、5型腺病毒DNA与12型腺病毒DNA、大肠杆菌DNA序列的对比研究
  • ISSN号:0577-7402
  • 期刊名称:《解放军医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R342.38[医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]第三军医大学基础部药理学教研室,重庆400038, [2]解放军第97医院烧伤科
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30271512)
中文摘要:

目的通过对2型、5型人腺病毒DNA(Adv2、5 DNA)与Adv12 DNA及大肠杆菌DNA(EC DNA)序列进行对比研究,确定Adv2、5 DNA中能够拈抗细菌DNA的可能的活性片段——抑制性CpG寡核苷酸(CpG-N ODN)。方法从NCBI核酸数据库中获取Adv2、5、12 DNA和EC DNA序列,采用DNATools、BioEdit等软件对Adv2、5、12 DNA和EC DNA进行序列分析和比较,确定Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,查找出Adv2、5 DNA中以上述CpG基序为核心的12碱基寡核苷酸(12-ODN)。结果确定了19种Adv2、5 DNA特征性的CpG基序,Adv2、5 DNA中以这19种CpG基序为核心的12-ODN共504条。结论504条12-ODN可能是Adv2、5 DNA的CpG-N ODN。

英文摘要:

Objective To identify the putative CpG-N ODNs in adenovisus 2 DNA (Adv2 DNA) and Adv5 DNA by comparing the sequence difference among Adv2, 5, 12 DNA and E.coli (EC) DNA. Methods Sequences of Adv2, 5, 12 DNA and EC DNA were obtained from the Entrez Nucleotides database at NCBI. The specific CpG motifs of Adv2 DNA and Adv5 DNA were identified after above sequences were analyzed and compared by softwares such as DNATools, BioEdit, and so on. All the 12-ODNs with specific CpG motif core were searched from Adv2 DNA and Adv5 DNA. Results 19 specific CpG motifs were ascertained and 504 12-ODNs were detected in Adv2 DNA and Adv5 DNA. Conclusion 504 12-ODNs were putative CpG-N ODNs in Adv2 DNA and Adv5 DNA.

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期刊信息
  • 《解放军医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国人民解放军总后勤部卫生部
  • 主办单位:人民军医出版社
  • 主编:
  • 地址:北京市100036信箱188分箱
  • 邮编:100036
  • 邮箱:mjcpla@pmmp.com.cn
  • 电话:010-51927306
  • 国际标准刊号:ISSN:0577-7402
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1056/R
  • 邮发代号:2-74
  • 获奖情况:
  • 全军医学期刊质量评比优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30614