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结核分枝杆菌抗原Rv1258c、Rv1410c及Rv3425的HLA限制性CTL表位预测
  • ISSN号:1671-6825
  • 期刊名称:《郑州大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R52[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]郑州大学生物工程系,郑州450001
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目30872381; 河南省杰出人才基金资助项目084200510014
中文摘要:

目的:预测结核分枝杆菌(MTB)相关抗原Rv1258c、Rv1410c及Rv3425的HLA限制性细胞毒性T细胞(CTL)表位。方法:通过NCBI数据库获取各蛋白的氨基酸序列,利用BLAST分析其与人类蛋白质的同源性,利用SYFPEITHI、BIMAS和NetCTL数据库预测分析MTB相关抗原的HLA-A2与HLA-A3限制性CTL表位。结果:初步筛选出3个候选抗原的HLA-A2和HLA-A3限制性CTL优势表位,分别为Rv1258c343~351、380~388、290~298、52~60;Rv1410c510~518、470~478、452~460、420~428;Rv3425118~126、43~51、29~37。结论:预测出MTB3个相关抗原的HLA-A2与HLA-A3限制性CTL表位,为抗结核多表位疫苗的研究奠定了基础。

英文摘要:

Aim:To predict the HLA restricted cytotoxic T lymphocyte(CTL)epitopes in Mycobacterium tuberculosis antigens Rv1258c,Rv1410c and Rv3425.Methods:The amino acid sequences of the antigens were obtained from NCBI database.Their homologies to human proteins were analyzed by BLAST.HLA-A2-and HLA-A3-restricted CTL epitopes were predicted by SYFPEITHI,BIMAS and NetCTL.Results:The predominant HLA-A2-and HLA-A3-restricted CTL epitopes predicted from the three candidate antigens were Rv1258c 343~351,380~388,290~298,52~60;Rv1410c 510~518,470~478,452~460,420~428;and Rv3425 118~126,43~51,29~37.Conclusion:Eleven HLA-A2-and HLA-A3-restricted CTL epitopes have been predicted from Mycobacterium tuberculosis antigens Rv1258c/Rv3425/Rv1410c,which could be used in research of antituberculosis multi-epitope vaccine.

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期刊信息
  • 《郑州大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:河南省教育厅
  • 主办单位:郑州大学
  • 主编:辛世俊
  • 地址:郑州市高新区科学大道100号
  • 邮编:450001
  • 邮箱:xzshi@126.com
  • 电话:0371-67781728
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6825
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1340/R
  • 邮发代号:36-111
  • 获奖情况:
  • 综合性医药卫生类核心期刊,教育部优秀科技期刊一等奖,中国优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15607