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结核分枝杆菌耐药相关药物外排抗原HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测
  • ISSN号:1671-6825
  • 期刊名称:《郑州大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R52[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]郑州大学生物工程系,郑州450001
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目30872381; 河南省杰出人才基金资助项目084200510014
中文摘要:

目的:预测结核分枝杆菌(MTB)耐药相关药物外排抗原(Rv1634、Rv2846c、Rv2937、Rv2686c、Rv2687c及Rv3065)的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位。方法:通过NCBI数据库获取目的蛋白的氨基酸序列,运用BLAST分析它们与人类蛋白的同源性,利用SYFPEITHI、BIMAS和NetCTL数据库软件预测HLA-A2限制性CTL表位。结果与结论:预测筛选出6个候选抗原的21个HLA-A2限制性CTL优势表位。

英文摘要:

Aim:To predict the HLA-A2 restricted CTL epitopes in Mycobacterium tuberculosis drug efflux antigens (Rv1634,Rv2846c,Rv2937,Rv2686c,Rv2687c,and Rv3065).Methods:The amino acid sequences of the antigens were obtained from NCBI database.Their homology to human proteins was analyzed by BLAST.HLA-A2 restricted T lymphocyte epitopes were predicted by SYFPEITHI,BIMAS,and NetCTL.Results and Conclusion:A total of 21 predominant HLA-A2 restricted T lymphocyte epitopes were predicted from the six candidate antigens.

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期刊信息
  • 《郑州大学学报:医学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:河南省教育厅
  • 主办单位:郑州大学
  • 主编:辛世俊
  • 地址:郑州市高新区科学大道100号
  • 邮编:450001
  • 邮箱:xzshi@126.com
  • 电话:0371-67781728
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-6825
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1340/R
  • 邮发代号:36-111
  • 获奖情况:
  • 综合性医药卫生类核心期刊,教育部优秀科技期刊一等奖,中国优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15607