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小孢子链格孢OPA2-1核苷酸序列分析及系统发育研究
  • ISSN号:1672-6472
  • 期刊名称:《菌物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.1[生物学—微生物学] S852.652[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学植物保护学院,杨凌712100, [2]西藏大学农牧学院农学系,林芝860000
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30771735):教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目(No.IRT0748);高等学校学科创新引智计划项目(No.B07049)
中文摘要:

本研究采用引物对OPA2-1L/OPA2-1R对供试小孢子链格孢菌株OPA2-1区段进行扩增,所有菌株都可获得PCR产物。核苷酸序列分析表明:不同小孢子链格孢种OPA2-1核苷酸序列存在明显差异。利用邻近结合法构建系统发育树,供试菌株被分为8个组,梨黑斑链格孢Alternaria gaisen、长柄链格孢A.longipes、树状链格孢A.arborescens明显被归于不同分支,显示OPA2-1核苷酸序列对这些种均具有区分能力;链格孢A.alternata的一些不同分离物被聚在不同组中,说明链格孢A.alternata存在明显遗传差异,可能为一个复合体。OPA2-1核苷酸序列富于变化,可作为小孢子链格孢系统发育研究的一种有用的手段。

英文摘要:

The OPA2-1 region of small-spored Alternaria species was amplified with specific primer pairs, OPA2-1L/OPA2-1R, all strains produced one single same size band. The analysis of their nucleotide acid sequences indicates that certain differences were found in nucleotide sequences among these species. The phylogenetic tree constructed based on neighbor-joining method 6bows that these isolates were divided into eight clades. Alternaria gaisen, A. longipes and A. arborescens were clustered into different clades, while isolates ofA. alternata were distributed into different groups. It shows that A. alternata should be treated as a species complex. It is found that clear variations were present in the OPA2-1 sequences of all tested small-spored Alternaria species, it provides a meaningful information for phylogenetics of small-spored Alternaria species.

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期刊信息
  • 《菌物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国菌物学会
  • 主编:戴玉成
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
  • 邮编:100101
  • 邮箱:jwxt@im.ac.cn
  • 电话:010-64807521
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6472
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5180/Q
  • 邮发代号:2-499
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5637