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基于边缘分布模型的基因选择方法
  • ISSN号:1000-7024
  • 期刊名称:《计算机工程与设计》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]江苏科技大学计算机科学与工程学院,江苏镇江212003
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(51008143).
作者: 段旭[1]
中文摘要:

一个微阵列数据集包含了成千上万的基因、相对少量的样本,而在这成千上万的基因中,只有一少部分基因对肿瘤分类是有贡献的,因此,对于肿瘤分类来说,最重要的一个问题就是识别选择出对肿瘤分类最有贡献的基因。为了能有效地进行微阵列基因选择,提出用一个边缘分布模型(marginal distributionmodel,MDM)来描述微阵列数据。该模型不仅能区分基因是否在两样本中差异表达,而且能区分出基因在哪一类样本中表达,从而选择出的基因更具有生物学意义。模拟数据及真实微阵列数据集上的实验结果表明,该方法能有效地进行微阵列基因选择。

英文摘要:

A microarray data set contains thousands of genes, a small quantity of samples, and in the tens of thousands of genes, only a few genes that contribute to cancer classification. So, one basic and important question associated with cancer classification is to identify choose the classification of the most contribution cancer genes. In order to effectively microarray gene choice, a marginal dis- tribution model (MDM) is proposed to describe microarray data sets. Based on MDM, it not only can distinguish whether the gene is in two samples differentially expressed genes, and can distinguish which kind of samples expression. Consequently, the selected genes are more informative in the following analysis of the microarray. The results obtained from the simulated and real microarray data sets show that our method is performance well.

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期刊信息
  • 《计算机工程与设计》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国航天科工集团
  • 主办单位:中国航天科工集团二院706所
  • 主编:汤铭瑞
  • 地址:北京142信箱37分箱
  • 邮编:100854
  • 邮箱:ced@china-ced.com
  • 电话:010-68389884
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7024
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1775/TP
  • 邮发代号:82-425
  • 获奖情况:
  • 中国科学引文数据库来源期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊,中国科技论文统计与分析用期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:45616