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蛋白质芳香基团的1H-13C HSQC信号增强研究
  • ISSN号:1000-4556
  • 期刊名称:《波谱学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:O482.53[理学—固体物理;理学—物理]
  • 作者机构:[1]波谱与原子分子物理国家重点实验室(中国科学院武汉物理与数学研究所),湖北武汉430071, [2]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:National Natural Science Foundation of China (20875098,21075132),National Major Basic Research Program of China (2009CB918603),and the Ministry of Science and Technology of China (2009IM030700).
中文摘要:

含芳香环的氨基酸残基多处于蛋白质的疏水内核或者是蛋白质与配体的结合部位,这些残基间的非共价键相互作用对于蛋白质结构的稳定性和生物的特异性识别有重要意义.因此,在蛋白质的核磁共振研究中,芳香基团被认为是一个研究蛋白质结构动力学的潜在探针.但是由于芳香基团的1H-13C HSQC谱的灵敏度较低,目前,利用核磁共振对其进行研究乏善可陈.造成这一现象的主要原因可能在于芳香环体积较大,往往存在慢的翻转运动,导致其NMR信号被展宽.作者利用CPMG-INEPT HSQC序列可以有效地减小慢运动影响的特征,将其应用到了GB1蛋白质芳香环的1H-13CHSQC谱中,有效的增强了芳香基团HSQC谱信号的灵敏度,得到了部分在常规HSQC中无法观测的信号.

英文摘要:

Aromatic side chains are usually located in the hydrophobic core or ligand binding sites of proteins. They play important roles in protein functions such as structure stabilization and biological recognition through noncovalent interactions. Thus, aromatic side chains are considered to be a promising probe to determine the structure and dynamics of protein through NMR. However, they are not frequently studied in practice. One of the reasons is that some NMR signals of aromatic rings are rarely observed due to the severely line broadening induced by complex slow internal motion. In this study, CPMG-INEPT 1H-13C HSQC was employed to detect the aromatic resonances of protein GB1. It was found that some unobservable peaks in routine 1H-13C HSQC spectrum could be recovered in the corresponding CPMG-1NEPT 1H-13C HSQC spectrum. This indicated that the CPMG-INEPT 1H-13C HSQC may be an effective alternation to routine 1H-13C HSQC for detecting the resonances of aromatic rings in proteins.

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期刊信息
  • 《波谱学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院武汉物理与数学研究所 中国物理学会波谱学专业委员会
  • 主编:刘买利
  • 地址:湖北省武汉市武昌小洪山西区30号
  • 邮编:430071
  • 邮箱:magres@wipm.ac.cn
  • 电话:027-87198791
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4556
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1180/O4
  • 邮发代号:38-313
  • 获奖情况:
  • 1992 年获国家科委、中宣部、新闻出版署首届优秀...,获中国科1996年获中国科学院优秀期刊三等奖,1999年获第三届湖北省优秀期刊奖 ,并被列为湖北...,2001年获第四届湖北省优秀期刊奖,2006年获第五届湖北省优秀期刊奖,2008年获第六届湖北省优秀期刊奖,2010年获第七届湖北省优秀期刊奖---湖北省专业技...,2013年获第八届湖北省优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:2740