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中国人群转化生长因子β信号通路上的基因多态性与非综合征型唇腭裂的关联研究
  • ISSN号:1671-167X
  • 期刊名称:《北京大学学报:医学版》
  • 分类:R181.33[医药卫生—流行病学;医药卫生—公共卫生与预防医学]
  • 作者机构:[1]北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,北京100191, [2]北京市疾病预防控制中心,北京100013, [3]林口长庚纪念医院医学研究部,中国台湾桃园市33305, [4]武汉大学口腔医院儿童口腔科,武汉430079, [5]MountSinaiMedicalCenter,NewYork10029,USA, [6]中国医学科学院,北京协和医学院基础学院医学遗传学系,北京100005, [7]四川大学华西口腔医学院口腔颌面外科,口腔疾病研究国家重点实验室,成都610041, [8]青岛大学医学院口腔外科,青岛266000, [9]JohnsHopkinsUniversity,SchoolofPublicHealth,Baltimore,Maryland21205,USA
  • 相关基金:国家自然科学基金(81102178)资助
中文摘要:

目的::探索中国人群中转化生长因子β( transforming growth factor-β, TGFB)信号通路基因多态性与非综合征型唇腭裂( non-syndromic oral clefts, NSOC)的关联关系及可能存在的基因环境交互作用。方法:在806个中国汉族人群非综合征型唇裂合并或不合并腭裂( non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, NSCL/P)核心家系中,对TGFB信号通路上的10个基因进行了传递不平衡检验以及基因环境交互作用分析。环境因素包括母亲孕早期吸烟、被动吸烟、饮酒及补充多维生素制剂。结果:经过质量控制的筛选,共对343个位点的单核苷酸多态性( single nucleotide polymorphisms, SNPs)进行了传递不平衡检验及交互作用分析,结果显示,共有6个基因中的19个SNPs与NSCL/P之间存在关联(P〈0.05),但经过Bonferroni校正后,这些关联均不具有统计学意义。经多重检验校正后,未发现常见孕期环境暴露因素与TGFB信号通路上的基因多态性存在有统计学意义的基因环境交互作用。结论:未发现TGFB信号通路上的基因多态性与NSCL/P之间存在关联。

英文摘要:

Objective:To explore the association between 10 candidate genes on transforming growth fac-tor-β ( TGFB) signaling pathway and non-syndromic cleft lip with or without cleft palate ( NSCL/P) among Chinese populations, and to study the gene-environment interaction. Methods:A total of 806 Chinese Han NSCL/P trios were ascertained from an international consortium, which conducted a genome-wide associa-tion study using a case-parent trio design to investigate the genes affecting risk to NSCL/P. The transmis-sion disequilibrium test ( TDT) was used to test for effects of 343 single nucleotide polymorphisms ( SNPs) in 10 genes on TGFB signaling pathway including DCN, TGFB1, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, BAMBI, SMAD2, SMAD3 and SMAD4. The conditional regression models were used to test for gene-envi-ronment interaction. Results: For TDT, although 19 SNPs showed nominal significant association with NSCL/P, no significant evidence of association was seen for all SNPs in 806 NSCL/P trios after Bonferroni correction. The interactions between genes and maternal smoking, environmental tobacco smoke, alcohol consumption and multi-vitamin supplementation during pregnancy did not attain statistical significance after correction for multiple comparisons. Conclusion:No evidence for SNP effect of genes on TGFB signaling pathway and significant gene-environment interaction was seen in our data.

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期刊信息
  • 《北京大学学报:医学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:北京大学
  • 主编:韩启德
  • 地址:北京海淀区学院路38号
  • 邮编:100191
  • 邮箱:
  • 电话:010-82801551
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-167X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4691/R
  • 邮发代号:2-489
  • 获奖情况:
  • 1992年全国优秀科技期刊评比三等奖,1996年第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,2001年入选中国期刊方阵,被评为“双百”期刊,2007年获得第六届百种中国杰出学术期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16532