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中国人群叶酸/同型半胱氨酸代谢基因多态性与非综合征型唇腭裂关联研究
  • ISSN号:1671-167X
  • 期刊名称:《北京大学学报:医学版》
  • 分类:R181.33[医药卫生—流行病学;医药卫生—公共卫生与预防医学]
  • 作者机构:[1]北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,北京100191, [2]中国台湾长庚医院医学研究部,桃园33305, [3]武汉大学口腔医院儿童口腔科,武汉430079, [4]Mount Sinai Medical Center, New York 10029, USA, [5]中国医学科学院,北京协和医学院基础医学院医学遗传学系,北京100005, [6]四川大学华西口腔医学院口腔颌面外科,口腔疾病研究国家重点实验室,成都610041, [7]Johns Hopkins University, School of Public Health, Baltimore, Maryland 21205, USA
  • 相关基金:国家自然科学基金(81102178)、国际遗传学研究培训合作项目(NIH1)43TW06176)、国际口腔颌面部研究学会基金(U01-DE-018993)及唇腭裂危险基因和交互作用的国际合作研究项目(R01-DE-14458)资助
中文摘要:

目的:探索中国人群中叶酸/同型半胱氨酸代谢通路上的基因多态性与非综合征型唇腭裂(isolated non-syndromic cleft lip with or without eleft palate,NSCL/P)的关联关系及可能存在的基因一环境交互作用。方法:在806个中国人群的核心家庭中,对叶酸/同型半胱氨酸通路上的18个基因进行了传递不平衡检验以及基因一环境交互作用分析。环境因素包括母亲孕期吸烟、被动吸炯、饮酒及服用多维生素补充剂。结果:经过质量控制的筛选,共对257个位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行了传递不平衡检验及交互作用分析,结果显示,共有4个SNPs(rs6428977、rsl2060264、rs7730643和rs4920037)与NSCL/P显著关联(P〈0.05)。但在Bon—ferroni校正后,该通路上的代谢基因位点与NSCL/P之间的关联不具有统计学意义。经多重检验校正后,未发现常见孕期环境暴露与叶酸/同型半胱氨酸代谢通路上的基因多态性存在显著的交互作用。结论:未发现叶酸/同型半胱氨酸代谢通路上的基因多态性与NSCL/P之间存在关联。

英文摘要:

Objective :To explore the association between 18 candidate genes encoding enzymes on the folate/homocysteine metabolism pathway and non-syndromie cleft lip with or without cleft palate ( NSCL/ P) in Chinese populations. Methods: A total of 806 NSCL/P trios were drawn by an international consortium, which conducted a genome-wide association study using a case-parent trio design to investigate genes affecting risks to NSCL/P. The transmission disequilibrium test (TDT) was used for deviation from Mendelian expectations for 257 SNPs in 18 folate/homocysteine metabolism-related genes. The interactions between markers in these gene and environmental risk factors were also tested using conditional Logistic regressions. Results : Although four SNPs ( rs6428977, rs12060264, rs7730643 and rs4920037 ) showed nominal significant association with NSCL/P in the TDT on 806 NSCL/P trios (P 〈0.05) , no significant evidence of linkage and association remained in all the SNPs after Bonferroni correction. Similar tests for interactions between genes and maternal smoking, environmental tobacco smoke, alcohol consumption and multi-vitamin supplementation during pregnancy did not attain statistical significance after correction for multiple comparisons. Conclusion: Folate/homocysteine metabolism-related genes could not influence the risk of NSCIJP.

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期刊信息
  • 《北京大学学报:医学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:北京大学
  • 主编:韩启德
  • 地址:北京海淀区学院路38号
  • 邮编:100191
  • 邮箱:
  • 电话:010-82801551
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-167X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4691/R
  • 邮发代号:2-489
  • 获奖情况:
  • 1992年全国优秀科技期刊评比三等奖,1996年第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,2001年入选中国期刊方阵,被评为“双百”期刊,2007年获得第六届百种中国杰出学术期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16532