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人MTERF4基因启动子的生物信息学研究
  • ISSN号:1007-7847
  • 期刊名称:《生命科学研究》
  • 时间:0
  • 分类:Q811.4[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]大理大学基础医学院,中国云南大理671000, [2]云南省昆虫生物医药研发重点实验室,中国云南大理671000, [3]云南大学生命科学学院,中国云南昆明650091
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81560458,31601155); 云南省教育厅科学研究基金重点项目(2014Z126); 大理大学博士科研启动基金项目(BSKY2012018);大理大学大学生创新创业计划项目(201402)
中文摘要:

人线粒体转录终止因子4(mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4)基因属于线粒体转录终止因子基因超家族,其编码的蛋白质是调控线粒体核糖体生物合成和线粒体蛋白质翻译的重要因子。目前,MTERF4基因自身的表达调控机制仍不清楚。为了探讨人MTERF4基因启动子区的序列特征和基因转录调控机制,采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人MTERF4基因上游5'端的启动子分布、转录因子及其结合位点、CpG岛进行分析。结果表明,人MTERF4基因上游5'端3 000 bp的核苷酸序列至少存在3个启动子,其中1 799-2 368 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为558 bp的CpG岛。人和小鼠MTERF4同源基因的启动子区有1个保守区域,存在18个共有的转录因子结合位点。通过生物信息学软件分析人MTERF4基因启动子,提高了针对该基因启动子的研究效率,为后续实验深入研究启动子的功能奠定了重要的理论基础。

英文摘要:

Human mitochondrial transcription termination factor 4(MTERF4) gene belongs to MTERF gene superfamily.MTERF4 protein plays an important role in the mitochondrial ribosome biogenesis and the regulation of mitochondrial translation.However,the potential regulation mechanism of human MTERF4 gene expression is still undiscovered.In order to investigate the regulation mechanism of human MTERF4 gene promoter,online bioinformatics software and phylogenetic foot-printing methods were used to analyze the promoter distribution,transcription factors and their binding sites,CpG islands of human MTERF4 gene.The results showed that there are at least three promoters in the 5′ uncoding region of human MTERF4 gene.The core promoter of human MTERF4 gene is located between 1 799 bp and 2 368 bp,which plays a key role in the transcription of MTERF4.In addition,18 transcription factor binding sites were found in conserved promoter region of human and mouse homologous MTERF4 genes by P-Match 1.0 protocol.A 558 bp CpG island was found in human MTERF4 gene promoter region.Bioinformatics analysis of human MTERF4 gene promoter can improve the efficiency of promoter research,and provide significant information for the further experimental research of gene promoter function.

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期刊信息
  • 《生命科学研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南师范大学
  • 主办单位:湖南师范大学
  • 主编:梁宋平
  • 地址:长沙湖南师范大学生命科学学院1号档127#
  • 邮编:410081
  • 邮箱:life@hunnu.edu.cn
  • 电话:0731-8872616
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7847
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1266/Q
  • 邮发代号:42-172
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:5334