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温州地方株HPV16型L1基因多态性及蛋白特性分析
  • ISSN号:1001-7089
  • 期刊名称:《中国皮肤性病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R373.9[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]温州医学院微生物学与免疫学教研室,浙江温州325035
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30671882);温州市科技局科研基金资助项目(Y20060081).
中文摘要:

目的:了解温州地方株HPV16 L1基因结构特点,分析其结构蛋白L1基因多态性及蛋白特性变化,为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据。方法:设计HPV16型L1基因特异性引物,从宫颈癌组织标本提取DNA,进行PCR扩增鉴定,PCR产物直接测序;进一步用Vector NTI 8.0和DNAStar软件分析HPV16型L1基因多态性及蛋白特性变化情况。结果:测定的序列与标准基因序列(NC 001526)比较,温州地区宫颈癌感染的HPV16型L1基因同源性为99.1%~99.8%,分别形成8种突变模式,其中3处由于核苷酸的改变,翻译的氨基酸也相应发生变化,但其编码蛋白在亲水性、表面可及性及抗原性上与标准株相比较无明显变化。结论:温州地方株HPV16 L1核酸有一定程度的变异。

英文摘要:

Objective:To study the character of HPV L1 gene from Wenzhou area,and analyze changes of its polymorphism and protein property.Methods:The tissue DNA was extracted from cervical carcinoma.The L1 gene of HPV was amplified with PCR by 16 type specific primers,respectively.And L1 PCR products were identified by sequencing.At last,L1 gene polymorphism and protein property were analyzed with bio-soft of Vector NTI 8.0 and DNAStar.Results: Compared with standard L1 gene sequence(NC 001526),gene homology was 99.1%-99.8% and eight mutations were found in HPVI6 type,three of these mutations produced protein variations because of amino acids changed, but differences of their proteins were not found in hydrophilicity. surface probability and antigenic index compared with the standard L1 protein property. Conclusion: The results show that some mutation had taken place in the nucleotide sequence of L 1 gene of HPV 16 obtained from the cervical carcinoma tissues in Wenzhou area.

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期刊信息
  • 《中国皮肤性病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西安交通大学
  • 主编:彭振辉
  • 地址:陕西省西安市新城区皇城西路30号
  • 邮编:710004
  • 邮箱:CJDV_XG@126.com
  • 电话:029-87217312 87678312
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7089
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1197/R
  • 邮发代号:52-17
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊,中国生物医学类核心期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:25128