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中国水稻白叶枯病菌小种C8菌株无毒基因的分离及功能鉴别
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:中国水稻科学
  • 时间:0
  • 页码:988-990
  • 语言:中文
  • 分类:S432.2[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]南京农业大学植物保护学院/农业部病虫监测与治理重点开放实验室,江苏南京210095, [2]上海交通大学农业与生物学院,上海200240
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30710103902,30671354);国家863计划资助项目(2006AA02Z180);公益性行业(农业)科研专项经费资助项目(NYHYZX07-056).
  • 相关项目:水稻条斑病细菌avrBs3/PthA家族基因的鉴别与功能研究
中文摘要:

白叶枯病菌与水稻间的互作符合基因对基因模式,不同小种中存在特异的avrBs3/pthA家族基因。对中国水稻白叶枯病菌小种C8菌株基因组DNA进行BarnH I酶切和Southern杂交,发现了其特有的约6.0kb大小、含avrBs3/pthA家族基因的信号条带。经文库筛选、Southern杂交和限制性酶切分析,获得了C8小种avr/pthC8a基因。将该基因导入菲律宾小种6的代表菌株PXO99^A中,发现nur/pthC8a可使PXO99^A丧失对水稻品种Asominori(携有成株期抗性基因Xa17)的毒性,暗示avr/pthC8a可能是与Xa17相应的无毒基因。序列分析发现,avr/pthC8a基因大小为3816bp,编码1272个氨基酸,由102bp编码的34个氨基酸重复单元在基因内的重复数为20.5个,其3’端的BamHI酶切位点由GGATCc突变为AGATCC,其他特征均与avrBs3/pthA家族的成员相似,即C端存在1个亮氨酸拉链、3个核定位信号和1个酸性转录激活域。avr/pthC8a基因3’端的BamH I酶切位点发生突变在avrBs3/pthA家族基因中鲜有报道。中国C8小种avr/pthC8a基因的发掘,为进一步了解水稻黄单胞菌毒性变异以及avrBs3/pthA家族基因的进化提供了理论依据。

英文摘要:

The interaction between Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) and rice follows gene-for-gene model. A 6.0 kb particular fragment was identified from a Chinese race C8 strain of Xoo, through screening its genomic library by Southern blot with a highly conserved EcoR J -BamH I fragment of the avrBs3/pthA family as probe. This specific DNA contained an avirulence gene, namely avr/pthC8a, which transmitted the Philippine strain PXO99A from compatible into incompatible interactions with rice Asominori carrying R gene Xa17, suggesting that avr/pthC8a is possibiy corresponding for Xa17 specificity. Sequence analysis showed that avr/pthC8a, 3819 bp in size, is a avrBs3/pthA family member, and the repeat number of the I02 bp repeat unit is 20.5. The structure of the gene is almost as same as those of the avrBs3/pthA family genes at 5' and 3'-terminals. The putative protein has a lucine zipper, three nucleotide location signals and an acid transcriptional activation domain at C-terminal. The novel is that the BarnH I site at 3'-terminal of the gene is mutagenesis from GGATCC into AGATCC, which has not been reported so far. Thus, identification of avr/pthC8a of Chinese race C8 provides a fundamental understanding of virulence differentiation among different races of Xoo and coevolution of avrBs3/pthA genes with rice.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826