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一种有效的肿瘤特征基因筛选方法
  • ISSN号：1672-7207
  • 期刊名称：《中南大学学报：自然科学版》
  • 时间：0
  • 分类：TP311.13[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构：[1]北京工业大学电子信息与控制工程学院
  • 相关基金：北京市教育委员会科技计划项目(JC002011200903);国家科技重大专项(2009ZX07212-003);国家自然科学基金资助项目(61075110)
作者： 李建更[1], 李辉[1], 阮晓钢[1]
关键词： 特征基因, 偏最小二乘, 支持向量机, 特异性, 敏感性, 平均准确率
中文摘要：

提出一种新的特征基因选择方法(PLS_VIP_CFFS),将偏最小二乘变量投影重要性指标与启发式前向搜索结合。利用PLS_VIP_CFFS对胃癌、肺癌、白血病等4组基因表达谱数据进行特征基因的选择,将选择结果与支持向量机等分类方法结合未处理原数据集,考察特异性、敏感性及平均准确率等指标,并从生物学角度分析选取的特征基因。PLS_VIP_CFFS在4组数据集上选取的特征基因具有较强的生物意义,结合多种分类器所得各项指标以及分类正确率都比较高,因此,PLS_VIP_CFFS可作为一种可靠的特征基因选取方法。

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期刊信息
  • 《中南大学学报：自然科学版》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:中南大学
  • 主编：黄伯云
  • 地址：湖南长沙中南大学校本部
  • 邮编：410083
  • 邮箱：zngdxb@csu.edu.cn
  • 电话：0731-88879765
  • 国际标准刊号：ISSN：1672-7207
  • 国内统一刊号：ISSN：43-1426/N
  • 邮发代号:42-19
  • 获奖情况:
  • 首届全国优秀科技期刊评比一等奖,第二届全国优秀科技期刊评比一等奖,首届中国有色金属工业优秀科技期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）
  • 被引量:20874