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异色瓢虫乳酸脱氢酶基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:2095-039X
  • 期刊名称:中国生物防治学报
  • 时间:2011
  • 页码:458-463
  • 分类:S476.2[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护] Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310036, [2]北京市农林科学院植保环保所,北京100097
  • 相关基金:国家“973”计划项目(2009CBll9206,2006CBl02005-3);国家自~(31071731,31000880);杭州市科技局计划项目(20091133808)~浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划):杭州师范大学生物科学国家特色专业本科生科技创新项目;杭州师范大学优秀中青年教师支持计划(JTAS2011.叭.031)
  • 相关项目:TPS基因调控激发异色瓢虫抗逆潜能的作用机制研究
中文摘要:

乳酸脱氢酶(1acticdehydrogenase,LDH)是糖酵解途径的终止酶,在整个昆虫的发育阶段长期存在。本试验采用同源克隆和锚定PCR技术,从异色瓢虫Harmoniaaxyridis中克隆到HaxLDH基因的cDNA全序列(GenBank登录号HM362898),全长1336bp,包含214bp的3’非编码区域和123bp的5,非编码区域,可读框长999bp,编码332个氨基酸。通过软件分析,预测该基因编码蛋白的分子量为36.2kD,理论等电点为8.62;包含1个糖基化位点,无信号肽序列和跨膜结构。同源比对不同昆虫的LDH基因cDNA序列,发现HaxLDH拥有8个非常保守的结构域:DLQHG、TAGV/ARQK/RE/DGES/TRL、LVQRN、GSGTNLD、SCHGW/YI/VI/VGEHGD、VWSG/AVNV/IAGV、AYEV/IIK/RLKGYTS/NWAI/VGLS和LSLP。HaxLDH与赤拟谷盗Triboliumcastaneum的LDH同源性最高,达67%;系统发育分析也表明二者亲缘关系较近。本研究为探讨LDH在昆虫发育和逆境中的作用奠定了基础。

英文摘要:

Lactic dehydrogenase (LDH) of Harmonia axyridis was cloned by homological cloning and anchored PCR. The full length of HaxLDH cDNA sequence is 1336 bp (GenBank accession number HM362898), which contains a 3' untranslated region of 214 bp and a 5' untranslated region of 123 bp. HaxLDH cDNA contains an open reading frame of 999 bp, encoding a protein of 332 amino acids residues with calculated molecular mass of 36.20 kD and pI of 8.62. It has one potential N-glycosylation site (residue 352), with no signal peptide, putative cleavage sites and transmembrane domain. Blast analysis indicated that HaxLDH contains eight conservative domains, DLQHG, TAGV/ARQK/RE/DGES/TRL, LVQRN, GSGTNLD, SCHGW/YI/VINGEHGD, VWSG/AVNV/IAGV, AYEV/IIK/RLKGYTS/NWAI/VGLS and LSLP of LDH family. HaxLDH had 67% identity with that of Tribolium castaneum, and phylogenetic analysis shows that these two species are most closely related.

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期刊信息
  • 《中国生物防治学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院植物保护研究所 中国植物保护学会
  • 主编:杨怀文
  • 地址:北京圆明园西路2号
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgswfz@hotmail.com
  • 电话:010-62815625
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-039X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5973/S
  • 邮发代号:2-507
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1974