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异色瓢虫过氧化氢酶(Catalase)的基因克隆及序列分析
  • ISSN号:2095-1353
  • 期刊名称:应用昆虫学报
  • 时间:2014.1.1
  • 页码:1-10
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310036, [2]北京市农林科学院植物保护环境保护所,北京100097
  • 相关基金:资助项目:国家“973”计划项目(2012CB127605);国家自然科学基金(31071731);国家公益性行业(农业)科研专项(201303024)
  • 相关项目:TPS基因调控激发异色瓢虫抗逆潜能的作用机制研究
作者: 张帆|
中文摘要:

【目的】克隆异色瓢虫Harmonia axyridis保护酶系中过氧化氢酶(Catalase,CAT)的全长cDNA序列,并分析该基因的基本特性。【方法】采用同源克隆和锚定PCR技术,从异色瓢虫中克隆到HaraxCAT基因的cDNA全序列(GenBank登录号KC991026),并采用生物信息学的相关方法进行了分析。【结果】HaraxCAT的cDNA序列全长1781bp,其包含110bp的3‘编码区域和45bp的5’非编码区域,可读框长1626bp,编码541个氨基酸。预测该基因编码蛋白的分子量为61.55ku,理论等电点为8.33,包含3个糖基化位点,无信号肽序列和跨膜结构。并且该基因包含了一个长达18个氨基酸的潜在的活性位点序列FDRERIPERVVHAKGAGA和血红素配体信号序列RIFSYGDTH。同源比对不同昆虫的CAT蛋白序列,发现昆虫CAT非常保守,HaraxCAT与其他昆虫的同源性高达65%及以上,与赤拟谷盗Tribolium castaneum同源性最高,达75.25%;系统发育分析表明其与鞘翅目赤拟谷盗和白星金花龟Protaetia brevitarsis亲缘关系最近。【结论】获得异色瓢虫catalase基因的cDNA全长序列,证实昆虫CAT蛋白非常保守。

英文摘要:

[Objectives] To clone the full length cDNA sequence of the catalase gene from Harmonia axyridis, which codes for a kind of important protective insect enzyme, and analyze its basic characteristics. [Methods] Catalase (CAT) from Harmonia ax'yridis was cloned using homological cloning and anchored PCR, and the sequence analyzed using bioinformatic methods. [Results] The full length of the HaraxCAT eDNA sequence is 1 781 bp (GenBank accession number KC991026), which contains a 3' untranslated region of 110 bp and a 5' untranslated region of 45 bp. HaraxCAT eDNA contains an open reading frame of 1 626 bp, encoding a protein of 541 amino acids residues with a calculated molecular mass of 61.55 ku and pI of 8.33. It has three potential N-glycosylation sites, but no signal peptide, putative cleavage sites or transmembrane domain. HaraxCAT, including a proximal active site signature of FD .GAGA which encodes about 18 amino acids, also includes a proximal heme ligand signature of RIFSYGDTH. Blast analysis indicated that insect CAT proteins are very conservative; HaraxCAT has 〉 65% similarity to that of other insects. HaraxCAT had 75.25% similarity with the corresponding sequence of Tribolium castaneum, and phylogenetic analysis shows that it is most closely related to T. castaneum and Protaetia brevitarsis. [Conclusion] Sequence analysis of the catalase gene from H. aryridis confirms that insect CAT protein are very conservative.

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期刊信息
  • 《应用昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:戈峰
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号中科院动物所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:entom@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807137
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1353
  • 国内统一刊号:ISSN:11-6020/Q
  • 邮发代号:2-151
  • 获奖情况:
  • 96、2000年获中科院《优秀期刊三等奖》,92年获中国科协《优秀学术期刊一等奖》,2001进入“中国期刊”方阵,“双百”期刊,排名第96位
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3170