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团头鲂HoxB3a基因全长cDNA克隆及表达
  • ISSN号:1674-5566
  • 期刊名称:《上海海洋大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S917[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海201306
  • 相关基金:国家自然科学基金(30500382);上海市教委曙光项目(08SG50)和上海市重点学科建设项目(Y1101)
中文摘要:

Hox基因是脊椎动物一类重要的生长和发育调节基因,其所编码具螺旋-转角-螺旋结构的转录因子能与靶基因特定区域DNA结合,从而调节动物胚胎发育过程中体轴的形成和器官组织的生长。本研究采用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了团头鲂HoxB3a的全长cDNA,并对团头鲂不同时期的胚胎和成鱼的不同组织进行了RT—PCR分析,以探索HoxB3a基因的时空表达特征。序列比对分析结果显示,团头鲂HoxB3a编码的氨基酸序列与斑马鱼(Danio rerio)、大西洋鲑(Salmo salar)、红鳍东方纯(Takifugu rubripes)、青锵(Oryzias latipes)、条纹鲈(Morone saxatilis)、人(Homo sapiens)和小鼠(Mus musculus)的相似性分别为96%、85%、77%、76%、78%、66%和67%,同源性较高,这说明HoxB3a基因在长期的进化中具有较高保守性。RT—PCR结果表明,团头鲂HoxB3a基因从16hpf(hours post fertilization)胚胎期到出苗期都有表达,在成鱼大部分器官或组织中具表达活性,预示该基因存在着重要的生物学功能。Hoxb3a基因全长cDNA的克隆、胚胎不同阶段表达及组织细胞表达特征研究,为进一步探索该基因的发育通路奠定了基础。

英文摘要:

The Hox genes are a family of important growth and development regulatory genes in vertebrate. Their encoding helix-turn-helix transcription factors can combine with DNA in specific region to regulate the axial pattern formation and the growth of organs and tissues during ontogeny. In this study, the complete cDNAs of Megalobrama amblycephala Hoxb3a gene was cloned by rapid amplification of eDNA ends (RACE) and gene expression in embryos at different stages and in different tissues of adult fish were studied by RT- PCR. The deduced amino acid sequence was aligned with Danio rerio, Salmo salar, Takifugu rubripes, Oryzins latipes, Morone saxatilis, Homo sapiens and Mus musculus, and the sequence similarities are 96% , 85% ,77%, 76%, 78%, 66% and 67%, respectively, which illustrated that the HoxB3a gene was very conservative in the progress of evolution. The results of RT-PCR showed that Hoxb3a gene expressed from 16 hpf (hours post fertilization) to larvae and was almost found in all studied.

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期刊信息
  • 《上海海洋大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:上海市教委
  • 主办单位:上海海洋大学
  • 主编:陈裕东
  • 地址:上海市临港新城沪城环路999号
  • 邮编:201306
  • 邮箱:xuebao@shfu.edu.cn
  • 电话:021-61900229
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-5566
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2024/S
  • 邮发代号:4-604
  • 获奖情况:
  • 曾获《CAJ-CD规范》执行优秀奖,水产类期刊二等奖,全国优秀农业期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3383