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扁桃SFB基因的克隆及其生物信息学分析
  • ISSN号:1009-9980
  • 期刊名称:果树学报
  • 时间:0
  • 页码:170-175
  • 语言:中文
  • 分类:S662.9[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]新疆农业大学农学院, [2]新疆农业大学林学与园艺学院,新疆农业大学特色果树研究中心,乌鲁木齐830052
  • 相关基金:国家自然科学基金(30760146);国家科技支撑项目(2007BAD36B01)
  • 相关项目:扁桃(巴旦杏)自交不亲和性的分子机理研究
中文摘要:

以新疆扁桃栽培品种麻壳的花药为材料,利用RT-PCR和RACE技术,克隆到了一个全长为1131bp的SFB基因(Genbank登录号为:EU909685),命名为AcSFB10。该基因编码376个氨基酸,在N末端含有一个大约50个氨基酸组成的F-box基序。经生物信息学分析,推测AcSFB10蛋白的分子式为C2000H3033N517O558S23,相对分子质量为43985.5,等电点为6.02,二级结构以α螺旋为主;理论推导半衰期大约为30h,不稳定参数为53.21,属于不稳定蛋白;并且推测此蛋白为亲水性、非分泌型蛋白,在基质内起裂合酶的作用,特异性的识别底物,正好吻合了F-box蛋白的作用。

英文摘要:

A total length SFB gene (Genbank accession number: EU909685) named AcSFBIO was cloned with RT-PCR and RACE technology from the anther of almond planted in Xinjiang. AcSFBIO was 1131 bp in length encoding a protein of 376 amino acids,which had an F-box motif containing about 50 amino acids in the N-terminatio. With the bioinformatics analysis, the predicted A cSFB10 protein's molecular formula was C200H300N517O558S23; its relative molecular mass was 43985.5, isoelectric point was 6.02 and its secondary structure contained more a-helix. This protein was an instable protein whose deduced half-life was 30 h and instability parameter was 53.21. It is predicted this protein was hydrophilicity and non-secretory protein, had lyase activity and identified specific substrate which coincided with function of F-box protein.

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期刊信息
  • 《果树学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院郑州果树研究所
  • 主编:王志强
  • 地址:河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
  • 邮编:450009
  • 邮箱:chinagsxb@163.con
  • 电话:0371-65330928 653387308
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-9980
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1308/S
  • 邮发代号:36-93
  • 获奖情况:
  • 获河南省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18699