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利用SSR标记研究85个玉米自交系的遗传多样性
  • ISSN号:1005-0906
  • 期刊名称:《玉米科学》
  • 时间:0
  • 分类:S513[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院作物科学研究所玉米研究中心,北京100081, [2]沈阳农业大学,沈阳110161
  • 相关基金:国家自然基金(30300223)、农业部“948”重大专项(2006-G03)
中文摘要:

利用均匀分布在玉米基因组上的70对SSR引物研究了73个国内外早熟类群玉米自交系、6份CIM-MYT标准测验种和6份国内标准测验种的遗传多样性。研究结果表明,70对引物在供试材料中共检测出286个等位基因变异,每对引物检测出2。8个等位基因,平均4.1个。每个位点的多态性信息量(PIC)变化为0.18~0.81,平均为0.58。85个自交系之间的遗传相似系数变化范围在0.43—0.93之间,平均为0.66。UPGMA聚类分析表明,85份供试自交系划分为6个亚群合并后为A、B两大类群,主坐标分析结果与聚类分析结果相似,均与自交系系谱来源关系基本一致。外来种质和未知自交系被划分到相应的杂种优势类群。

英文摘要:

Simple sequence repeat (SSR) analysis of the 70 loci distributed uniformly throughout the maize genome were carried out for seventy-three early-mutation inbred lines and six testers from China and other six testers from CIMMYT. Seventy loci identified 285 polymorphic amplified fragments. The average number of allele per SSR locus was 4.1 with a range from 2 to 8. The polymorphism information content(PIC) for the SSR loci varied from 0.18 to 0.81 with an average of 0.58. Genetic similarities among the 85 inbred lines ranged from 0.43 to 0.93 with an average of 0.66. The cluster analysis showed that the inbred lines could be classified into 6 sub-clusters which can be combines to A and B clusters. The results of the principal coordinate analysis(PCoA) were similarly to that of the cluster analysis, and both were consistent with the groups based on the available pedigree. Exotic lines and unknown lines were also be effectively assigned to certain groups.

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期刊信息
  • 《玉米科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:吉林省农业科学院 国家玉米工程技术研究中心(吉林) 国家玉米改良中心 中国农业科技东北创新中心
  • 主编:才卓
  • 地址:吉林省长春市净月开发区彩宇大街1363号
  • 邮编:130033
  • 邮箱:ymkx@cjaas.com
  • 电话:0431-87063137 87063141
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-0906
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1201/S
  • 邮发代号:12-137
  • 获奖情况:
  • 荣获第三届全国优秀农业期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18972