大学在本质上是融学术性与契约性为一体的一组契约联合网络,大学治理的本原性质可以表述为基于行政权力与学术权力的利益相关者博弈均衡的概要表征,其治理要义为基于决策权的行政权力与学术权力的匹配。日本国立大学分阶段地移植和模仿了他国的治理制度,逐渐探索出了一条基于大学自治与学术自由的自主创新之路,并于2004年全面实施了国立大学法人化改革。根据日本国立大学治理制度变迁的规律与经验,中国大学治理制度创新的方向是实现“行政型治理”向“学术型治理”的转型。