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内皮素-1在均匀流中构象改变的分子动力学模拟
  • ISSN号:2095-3135
  • 期刊名称:集成技术
  • 时间:2014
  • 页码:17-26
  • 分类:TG156[金属学及工艺—热处理;金属学及工艺—金属学]
  • 作者机构:[1]中国科学院深圳先进技术研究院,深圳518055
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(31100850);深圳杰出青年基金项目(SW201110059):国家自然科学基金项目(11204342);深圳市科技创新委员会项目(JCYJ20120615140912201);深圳市孔雀计划项目(KQCX20130628112914299).
  • 相关项目:蛋白质折叠高效模拟方法及折叠病致病机理研究
中文摘要:

内皮素ET-1(Endothelin-1)与其受体ETA(Endothelin-A)和ETB(Endothelin-B)的相互作用控制血管紧张度,维持血压,与心血管疾病关系密切。ET-1与血管内皮的ETB结合介导血管舒张,而与血管平滑肌的ETA和ETB结合则引起血管收缩。ET-1只有在存在正常血流的体内实验才表现出明显的舒张活性,且其结构具有柔性,故推测血流的剪切应力可能控制了它的构象,进而调控它与ETB的结合。文章利用流动分子动力学计算机模拟方法,研究了均匀流中质心受约束的内皮素ET-1的构象。实验结果观察到该分子的羧基端往氨基端靠近,整个分子变得紧凑。这个发现对研究ET-1与ETB的相互作用和设计基于ET-1的心血管药物将会有一定的指导意义。

英文摘要:

Interactions of ET-1 (Endothelin-1) with its receptors ETA (Endothelin-A) and ETB (Endothelin-B) regulate the vascular tone, maintain the blood pressure, and are closely related to cardiovascular diseases. Binding of ET-1 with ETB in the vascular endothelium induces vasodilation, while binding with ETA and ETB in vascular smooth muscle results in vasoconstriction. Because ET-1 only induces vasodilation in vivo when the blood flow is present, we speculate that the shear stress of the blood flow may control the conformation of ET-1 through its structural flexibility, thus regulate its binding with ETB. By flow molecular dynamics simulation, the conformational changes of ET-1 in uniform flow were studied with its center of mass constrained. It is found that the C-terminal of ETol gets closer to the N-terminal in the simulation, resulting in a compact structure. This finding may provide guidance for the study on the interaction between ET-1 and ETB and the design of ET-1-based cardiovascular drugs.

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期刊信息
  • 《集成技术》
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院深圳先进技术研究院;科学出版社
  • 主编:樊建平
  • 地址:深圳市南山区西丽深圳大学城学苑大道1068号
  • 邮编:518055
  • 邮箱:jcjs@siat.ac.cn
  • 电话:0755-86392070
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-3135
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1691/T
  • 邮发代号:46-139
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:326