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逆转录法筛选mRNA靶点设计核酶对GPA的表达干预实验研究
  • ISSN号:1671-8135
  • 期刊名称:《中国生物工程杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q522[生物学—生物化学] R914.2[医药卫生—药物化学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]安徽医科大学,合肥230032, [2]军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京100850
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81072565,30271546)
中文摘要:

采用自行设计5’固定3’随机的文库对基因mRNA进行杂交用于逆转录反应以筛选mRNA的寡核苷酸结合靶点。对人I型跨膜糖蛋白-血型糖蛋白A(glycophorinA,GPA)的mRNA筛选了4个反义寡核苷酸可结合靶点,分别设计反义核酸(Antisense),分别加入mRNA中用RNaseH验证各靶点的核酸结合和切割效率,最终确定2个高效结合和切割靶点。再设计Ribozyme,构建表达核酶(Ribozyme)质粒,利用慢病毒(Lentivirus)包装技术,感染人源红系白血病细胞株K562细胞,在细胞水平验证其下调GPA基因表达的效果,对转染细胞mRNA进行反转录和RealTimePCR分析mRNA表达水平,并在蛋白水平进行了WesternBlot分析。结果表明文库结合逆转录方法筛选靶点设计的Ribozyme具有高效率下调膜受体表达的作用,GPA为I型跨膜糖蛋白,该实验为筛选mRNA靶点提供参考方法,并对膜受体表达干预有参考价值。

英文摘要:

An oligodeoxynucleotide library which the sequence were defined at 5 prime and randomized at 3 prime was employed to screen mRNA accessible targets, in reverse transcription and PCR after hybridized the library with mRNA. The mRNA of Glycophorin A ( GPA), type I transmembrane glyeoprotein, was screened and obtained 4 targets sequences. Accordingly 4 antisense nucleic acids designed respectively, the binding efficiency of every target were verified by using RNase H with antisense nucleic acids. Among them 2 targets showed better effects on binding and cutting. Designed 2 ribozymes to these targets, packaged in lentivirus system, then infected K562 cells( human erythroid leukemia line) , the down-regulation effect of gene expression was validated by Real Time RT-PCR and by Western Blot. It was found that the screened targets showed the best effective knocking down effects on gene expression. The study provided a reference for mRNA targets screening and Ribozyme design, and was helpful in membrane receptor expression interference, since GPA is a transmembrane protein.

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期刊信息
  • 《中国生物工程杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院文献情报中心 中国生物技术发展中心 中国生物工程学会
  • 主编:张树庸
  • 地址:北京市中关村北四环西路33号
  • 邮编:100080
  • 邮箱:biotech@mail.las.ac.cn
  • 电话:010-82624544 82626611-6631
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-8135
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4816/Q
  • 邮发代号:82-673
  • 获奖情况:
  • 1991年中国科学院科技进步三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12959