位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
Allele frequency of somatic mutations in individuals reveals signatures of cancer-related genes
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q347[生物学—遗传学] S666.3[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]School of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China, [2]School of Life Sciences and Technology, ShanghaiTech University, Shanghai 200031, China, [3]Key Laboratory of Systems Biology, Institute of Biochemistry and Cell Biology, Shanghai Institute for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200031, China, [4]Shanghai Center for Bioinformation Technology, Shanghai Industrial Technology Institute, Shanghai 201203, China
  • 相关基金:This work was supported by the grants from the National Basic Research Program of China (Nos. 2011CB910204, 2011CB510102, and 2010CB529200), the National High-Tech Program of China (Nos. 2012YQ03026108 and 2013BAI101B09), and the National Natural Science Foundation of China (No. 31301032).
中文摘要:

在过去的十年,全面定序努力揭示了癌症相关的基因的签名,例如司机和旅客基因, oncogenes,和肿瘤 suppressor 基因(TSG )[1 ] 。这些签名提供在分子的水平定义癌症的一个工具并且增加我们癌症的理解。然而,揭示这些签名的当前的方法总是在一张大癌症人口探索变异的基因的复发,消费样品收集上的很多时间和钱,定序并且确认,进一步产生大量数据分析[2 ] 。我们想知道这些签名是否能从另外的方面被恢复。由于一系列变化从对恶意的损害良性,广泛的基因变化在单个肿瘤以内存在。在这个过程期间,司机基因提供一个选择生长优点给他们居住在的房间。因此,在一个个人的体的变化的等位基因频率,测量变化居住在的细胞的比例,能反映两个选择生长优点和变化的按年代先后的顺序。这里,我们作了一个努力在个人用体的变化的等位基因频率揭示癌症相关的基因的签名。

英文摘要:

Over the past decade, comprehensive sequencing efforts have revealed signatures of cancer-related genes, such as driver and passenger genes, oncogenes, and tumor suppressor genes (TSGs) [1]. These signatures offer a means of defining cancer at the molecular level and increase our understanding of cancers. However, current methods to reveal these signatures always explore the recurrence of mutated genes in a large cancer population, consuming a lot of time and money on sample col- lection, sequencing and validation, further generating large amounts of data to analyze [2]. We wonder whether these signatures could be recovered from other aspects. Owing to a series of mutations from be- nign to malignant lesions, extensive genetic variations exist within in- dividual tumors. During this process, driver genes provide a selective growth advantage to the cells they reside in.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851