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哺乳动物细胞色素P450酶中底物识别位点与功能的进化关系
  • ISSN号:1000-6737
  • 期刊名称:《生物物理学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q61[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240, [2]上海科技大学生命科学与技术学院,上海200031, [3]中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所系统生物学重点实验室,上海200031, [4]上海生物信息技术研究中心,上海201203
  • 相关基金:国家“973”计划项目(2011CB910204,2011CB510102,2010CB529200),科技部重大仪器专项项目(2012YQ03026108),国家科技支撑计划项目(2013BAll01B09),国家自然科学基金项目(31301032),中国博士后科学基金项目(2013M531226)
中文摘要:

细胞色素P450(cytochromeP450,CYP)酶存在于所有哺乳动物中,它们从共同的祖先通过基因倍增进化而来,以一种“爆炸性”的趋势形成了庞大的超家族。除代谢脂质等内源性物质外,部分CYP酶还在药物等外源性物质的代谢方面起到重要作用。通过收集和注释哺乳动物CYP酶的序列发现,家族规模发生显著变化的七个活跃亚家族均属于CYPl~4家族.相比之下,非CYPl~4家族的家族规模则基本保持稳定。基于二级结构的预测结果,六段底物识别位点(substrerecognitionsites,SRSs)的进化速率在CYPl~4家族中,特别是活跃的亚家族中,也显著快于非CYPl~4家族。同时,SRSl~3的进化速率显著快于SRS4~6,说明SRSl.3在更大程度上决定了CYP酶在进化过程中所获得的新功能。

英文摘要:

Cytochrome P450 (CYPs) enzymes exist in all kinds of mammals, which are descended from a single common ancestor via gene duplication and constitute a large superfamily through the expansion. Besides the lipid metabolism, CYPs are also engaged in the xenobiotics biodegradation and metabolism, especially the members of human CYP1~4 families which play important roles in drug metabolism. Seven active subfamilies (CYP2A, CYP2C, CYP2D, CYP2E, CYP2J, CYP3A and CYP4F) were found by sequence alignment and annotation, which have a strong trend to expand or shrink on the scale of family size during the evolution. In contrast, the family size of non-CYP1-4 families remains nearly the same among mammals. Evolutionary rates of six substrate recognition sites (SRSs) in CYP1-4 families, especially in the active subfamilies, are significantly higher than those in other families. In addition, SRS1-3 have faster evolutionary rates than SRS4~6, which indicates that SRS1-3 are more likely to determine the new functions of CYP enzymes during the evolution.

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期刊信息
  • 《生物物理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国生物物理学会
  • 主编:沈恂
  • 地址:北京朝阳区大屯路15号生物物理研究所内
  • 邮编:100101
  • 邮箱:acta@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888458
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6737
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1992/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 二次获得中国科协优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:7189