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五龄飞蝗不同发育时间实时定量PCR内参基因的筛选
  • ISSN号:2095-1353
  • 期刊名称:应用昆虫学报
  • 时间:2014.5.15
  • 页码:733-740
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]山西大学应用生物学研究所,太原030006
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31272380,31201710);山西省高等学校留学回国人员科研资助项目(201163)
  • 相关项目:冰期气候变化对稻蝗属物种谱系地理学和遗传分化的影响
中文摘要:

【目的】筛选5龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因,为相关研究提供基础数据。【方法】本文选取β-肌动蛋白(β-actin)、延长因子(EF-1α)、3.磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、核糖体蛋白49(RP49)、α-微管蛋白(α-Tubulin)和18S核糖体RNA(18SrRNA)基因作为候选内参基因,运用实时定量PCR(qPCR)方法研究各基因在5龄飞蝗不同发育时间的相对表达量,用geNorm与Normfinder软件分析这6个基因表达稳定性。【结果】geNorrn分析结果显示6个内参基因表达稳定度M值顺序为:β-actin(0.3720)〉RP49(0.3750)〉α-Tubulin(0.4030)〉18S rRNA(0.4270)〉EF-15(0.4970)〉GAPDH(0.6040)。M值越小表示基因表达稳定度越高,同时geNorm软件以标准化因子配对差异值(Pairwisevariations)0.15默认为取舍值,由于V2/3=0.098〈0.15,所以最适内参基因数目为2个。运用NormFinder软件也得出相似的结果。【结论】β-actin与RP49为5龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因。

英文摘要:

[Objectives] To identify the most appropriate reference genes on different days during the development of fifth-instar nymphs of Locusta migratoria to pave the way for relevant studies. [Metllods] Six genes were selected as candidate reference genes, including the beta actin gene (β-actin), the Elongation factor la gene (EF-la), the Glyeeraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene (GAPDH), the Ribosomal protein 49 gene (RP49), the Alpha tubulin gene (α-Tubulin) and the 18S ribosome RNA gene (18S rRNA). The relative expression of these genes on different days during the development of L. migratoria was detected with quantitative real-time PCR (qPCR). The expression stability of these genes was then investigated using geNorm and Normfinder software. [Results] Based on the results of geNorm analysis, the average expression stability (M) of the six genes was, in descending order; fl-actin (0.3720) 〉 RP49 (0.3750) 〉 α-Tubulin (0.4030) 〉 18S rRNA (0.4270) 〉 EF-la (0.4970) 〉 GAPDH (0.6040). The less the M value the more stable the gene expression. The software took 0.15 as a constant value for pairwise variations. The appropriate number of reference genes was 2 because V2/3=0.098 〈 0.15. Similar results were obtained using NormFinder software. [Conclusion] β-actin and RP49 are the most suitable reference genes during the development of fifth-instar nymph ofL. migratoria.

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期刊信息
  • 《应用昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:戈峰
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号中科院动物所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:entom@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807137
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1353
  • 国内统一刊号:ISSN:11-6020/Q
  • 邮发代号:2-151
  • 获奖情况:
  • 96、2000年获中科院《优秀期刊三等奖》,92年获中国科协《优秀学术期刊一等奖》,2001进入“中国期刊”方阵,“双百”期刊,排名第96位
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3170