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鹿角珊瑚中肿瘤坏死因子TNF-α抑制剂的计算机虚拟筛选
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:R965.2[医药卫生—药理学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]海南大学海洋学院热带生物资源教育部重点实验室,海南海口570228
  • 相关基金:教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目(IRT1123); 海南省教育厅高等学校科学研究资助项目(Hjkj); 海南大学青年基金资助项目(qnjj1151)
中文摘要:

[目的]通过计算机虚拟筛选,从鹿角珊瑚化合物构建的数据库中寻找作为TNF-α抑制剂的先导化合物。[方法]采用Chem Office Ultra 2008的Chem Draw绘制分子化学结构,Chem Finder构建配体数据库,Molecular Operating Environment v2008.10(MOE)寻找TNF-α受体的三维结构活性部位,对配体小分子进行2次3D衍生,然后对接打分,筛选最理想的类药分子。[结果]鹿角珊瑚中分离的成分及其衍生物中含有多个TNF-α受体蛋白对接效果很好的化合物,并且有2个化合物的效果活性接近阳性对照配体。[结论]鹿角珊瑚中分离的成分及其衍生物中2个化合物有助于肿瘤治疗的发展。

英文摘要:

[Objective] Through virtual screening,the lead compound used for small molecule inhibitors of tumor necrosis factor-α(TNF-α) was searched in the database of Acopora.sp.[Method] ChemDraw of ChemOffice Ultra 2008 was used to draw molecular structure of chemistry,then ChemFinder was used to construct ligand database,and Molecular Operating Environment v2008.10(MOE)was applied to search the active site of three-dimensional structure of TNF-α receptors.The small ligand molecule was carried out two-times 3D derivation,and then scored to screen the most desired drug-like molecules.[Result] The components separated from Acopora sp.and their derivatives contained multiple compounds with good docking effect to TNF-α receptor protein,and the effects of 2 compounds was close to positive control ligand.[Conclusion] Two compounds in separated components from Acopora sp.and their derivatives could be helpful for development of tumor therapy.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995