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嗜水气单胞菌FNR的表达、纯化及酶活分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q554[生物学—生物化学] Q936[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]华中师范大学生命科学学院 ,武汉 430079
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30771429,31071653)、湖北省自然科学基金项目(2011CDB153)和中央高校基本科研业务费专项(CCNU12A02001)资助
中文摘要:

铁氧还蛋白还原酶(Ferredoxin-NADP+ reductases,FNR)是一种在生物体的多种代谢中起着重要作用的黄素酶. 为探讨嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)XS91-4-1中FNR的功能和结构,通过克隆其FNR基因,构建重组表达载体pET42a-fnr,表达并分离纯化了具有活性的GST-FNR融合蛋白,根据米曼氏动力学测定了纯化蛋白对NADPH及EDTA-Fe3+的酶活力,采用生物信息学方法对XS91-4-1 FNR蛋白序列进行系统学分析,并初步预测了该蛋白三维结构. 结果表明:重组质粒能够在宿主菌大肠杆菌(Escherichia coli)BL21中获得高效可溶性表达,经镍柱亲和层析法可纯化出电泳均一的目的蛋白,蛋白浓度为67.3 μg/mL;纯化蛋白对NADPH的比活力为1.78 U/mg,对EDTA-Fe3+的比活力为1.13 U/mg,比活力比粗酶分别提高了约29和22倍;生物信息学分析表明XS91-4-1 FNR分布在Bacterial-class FNR分支上且具有与此类FNR相似的结构特点. 上述结果显示嗜水气单胞菌FNR具有与已报道的FNR相似的基本特性,并推测其可能属于Bacterial-class FNR.

英文摘要:

Ferredoxin-NADP+ reductases (FNRs) are ubiquitous flavoenzymes that play an important role in many organisms. To investigate the structure and function of Aeromonas hydrophila FNR, FNR gene was cloned from A. hydrophila XS91-4-1. Recombinant plastimid pET42a-fnr was constructed and overexpressed in Escherichia coli BL21. FNR-GST recombinant protein was purified by nickel column affinity chromatography. According to Michaelis-Menten equation and double reciprocal plot, the enzyme activity of recombinant protein was assayed using NADPH and EDTA-Fe3+ as substrate. Then bioinformatics analysis of FNR was performed and three-dimensional structure of FNR was predicted. The results showed that FNR-GST recombinant protein was highly expressed in E. coli BL21 in a soluble form. Its protein concentration was 67.3 μg/mL. The specific activity for NADPH and EDTA-Fe3+ was 1.78 U/mg and 1.13 U/mg respectively, 29 and 22-fold higher after purification. Based on its sequence and phylogenetic relationship, the FNR of A. hydrophila XS91-4-1 was closely related to bacterial-class FNR. Our study suggested that the FNR of A. hydrophila belongs to bacterial-class FNR, and is similar to FNRs in many fundamental characteristics.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016