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玉米黑粉菌cyp51基因上游调控区克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:0577-7518
  • 期刊名称:植物保护学报
  • 时间:0
  • 页码:517-521
  • 语言:中文
  • 分类:S432.44[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护] Q811.4[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]华中师范大学生命科学学院,遗传调控与整合生物学湖北省重点实验室,武汉430079, [2]华中科技大学生命科学与技术学院,武汉430074
  • 相关基金:国家自然科学基金(30771429),科技部“863”项目(2007AA052417),教育部博士点基金(20060511002),湖北省科技攻关项目(2007AA201C50,2007AA301C26),国家大学生创新项目(081051113)
  • 相关项目:真菌细胞色素P450-14DM基因表达调控与农药抗性机理研究
中文摘要:

为探明玉米黑粉菌cyp51基因的表达调控机制,根据玉米黑粉菌cyp51基因cDNA的5’-序列,采用染色体步移技术,获得其5’-上游调控区序列,总长为490bp。利用NNPP分析软件预测转录起始位点,并采用TFSEARCH1.3软件分析转录因子结合位点。结果显示:转录起始位点位于上游134bp处;上游调控区不仅包含启动子的核心结构序列TATA盒(分别位于-30、-58、-318和-348bp处)和CAAT盒(分别位于-150、-161和-191bp处),亦包含多个转录因子结合位点,如AP-4、GATA-1、CdxA、Dfd和Oct-1等;在上游调控序列中嘌呤含量高,而且从-222bp处开始存在4个连续高嘌呤含量的热激转录因子特异性结合位点(HSE)。

英文摘要:

Based on the 5 '-end nucleotide sequence of cyp51, the upstream region of cyp51 was obtained by genome walking technique to investigate the regulatory mechanism of cyp51 gene expression. The upstream fragment of 490 bp was successfully cloned and sequenced. The transcription initiation site of cyp51 predicted by the NNPP software is located at 134 bp in front of ATG. Several c/s-acting elements analyzed by TFSEARCH 1.3 software were in the upstream region of cyp51, including not only the core promoter sequences TATA-box ( - 30, - 58, - 318, - 348 bp) and CAAT-box ( - 150, - 161, - 191 bp), but also several transcriptional element binding sites (AP4, GATA-1, CdxA, Dfd, and Oct-l, etc). The current study was benefit to further investigating the regulation of cyp51 over-expression and molecular mechanism involved in fungicides resistance of Ustilago mayd/s in future. In addition, there are four consecutive high-purine heat shock elements (HSE) located from -222 to -195 bp.

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期刊信息
  • 《植物保护学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术学会
  • 主办单位:中国植物保护协会
  • 主编:彩万志
  • 地址:北京圆明园西路中国农业大学植保学院
  • 邮编:100094
  • 邮箱:zbxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62732528
  • 国际标准刊号:ISSN:0577-7518
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1983/S
  • 邮发代号:82-620
  • 获奖情况:
  • 曾获中国科协优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:14691