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玉米两个功能未知转录因子基因的转录后加工
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:应用与环境生物学报
  • 时间:0
  • 页码:483-487
  • 语言:中文
  • 分类:S513.01[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30770466)资助 Supported by the National Natural Science Foundation of China (No. 30770466)
  • 相关项目:植物短串联重复序列介导的RNA可变剪接的分子机理
中文摘要:

ZmBH、ZmWD是玉米中分别具有转录因子bHLH和WD重复蛋白结构的两个功能未知基因,在不同组织中及各种胁迫诱导条件下,这两个基因均发生不同程度的剪接,产生大小各异的转录本.序列分析发现其剪接方式与经典的mRNA剪接不同,即剪接位点的选择不符合GT-AG或AT-AC规则,而是在剪接位点具有短正向重复序列SDR(Shortdirect repeats).ZmBH的转录后加工导致序列发生移码而提前终止,而ZmWD则缺失了大部分结构域序列,经由这种方式产生的转录后加工产物可影响蛋白编码,因而可能是对这两个基因功能进行调控的一种方式.图6表1318

英文摘要:

ZmBH and Zm WD, containing bHLH or WD40-repeat demain, are unknown function transcription factor-like genes in maize. Under different treatments, various transcripts were determined in the two genes. Sequence analyses demonstrated that unlike the classic splicing processes, the splicing sites were neither GT-AG nor AT-AC, but short-direct repeats (SDRs), which present surrounding splicing junctions in the individual splicing events. The unusual post-transcriptional processing led to a premature termination by introducing stop codon in ZmBH, and a deletion of functional domain in ZmWD. Therefore, the majority of the detected transcripts resulting from SDR-mediated post-transcriptional processing might have no capacity to encode functional proteins, suggesting a regulation mechanism of ZmBH and ZmWD. Fig 6, Tab 1, Ref 18

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016