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应用改进的通用荧光PCR引物进行多重STR分型
  • ISSN号:0250-3263
  • 期刊名称:动物学杂志
  • 时间:0
  • 页码:75-80
  • 语言:中文
  • 分类:Q81[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]东华大学化学化工与生物工程学院生物科学与技术研究所,上海201600, [2]上海市实验动物研究所-复旦大学-东华大学模式动物生物多样性联合实验室,上海201200
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30771191);
  • 相关项目:小鼠性发育启动调控基因的精细定位和克隆
中文摘要:

通过设计通用荧光PCR引物并结合DNA测序系统建立了小鼠的多重STR分型方案。实验针对小鼠基因组设计了两对不同的通用引物序列,标记了FAM荧光的通用序列和“加尾”的位点特异性引物共同用于小鼠的多重PCR的STR基因分型。本研究优化了通用引物和特异性引物间的比例,优化了多重STR-PCR的反应条件,并最终利用该技术方案实现了五重STR分型。实验验证了该方案在多重STR分型中的可行性。与传统的荧光检测PCR产物方案相比,应用通用方案完成多重PCR反应大大节省了实验时间与经费。

英文摘要:

This study established a multiplex STR genotyping system through universal fluorescent primers in combination with sequencing. For each panel of multiplex STR genotyping amplification, two sets of primers were used, namely universal primers labeled with FAM and specific primers with an added 5' tail. We optimized the proportion of universal and specific primers and reaction of multiplex PCR was achieved. By using this method, five STR marker loci genotyping were successfully conducted within a single reaction. The optimized universal fluorescent primers amplification genotyping system can be used in multiplex STR genotyping, which allows reliable, effective and low-cost genotyping compared with regular microsatellite fluorescent detection assays.

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期刊信息
  • 《动物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国动物学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:宋延龄
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:journal@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807162
  • 国际标准刊号:ISSN:0250-3263
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1830/Q
  • 邮发代号:2-422
  • 获奖情况:
  • 全国核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13064