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小鼠基因转录表达分析中内参基因的优选
  • ISSN号:1005-4847
  • 期刊名称:《中国实验动物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q95-33[生物学—动物学] Q344.13[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]东华大学生物科学与技术研究所,上海201620
  • 相关基金:国家自然科学基金面上项目(编号:30771191); 上海市科学技术委员会(编号:08140900902)
中文摘要:

目的建立小鼠基因转录表达分析中内参基因的选择方法。方法以C57BL/6J和C3H/HeJ两个品系3个不同组织及2个不同发育阶段为研究对象,应用反转录实时定量PCR技术,评价GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)、HPRT1(hypoxanthine phosphoribosyl transferase)、B2M(β2-microglobulin)、PPIA(peptidylprolyl isomerase A)、ACTB(Actin-beta)和18S rRNA(18S ribosomal RNA)等6个看家基因在下丘脑、垂体与卵巢中mRNA水平的表达稳定性。结果 GeNorm统计分析表明,GAPDH和HPRT1表达最为稳定,PPIA等次之,B2M在不同组织和发育阶段中都几乎无表达。结论成功筛选到GAPDH和HPRT1两个稳定表达的看家基因,证实了小鼠基因表达转录分析中内参基因选择的必要性和可行性。

英文摘要:

Objective To evaluate the sellection of suitable internal reference genes for normalization of gene expressions in mouse.Methods The expression levels of six housekeeping genes including GAPDH,HPRT1,B2M,PPIA,ACTB and 18S rRNA in the hypothalamus,pituitary and ovarian tissues and two developmental stages of C57BL/6J and C3H/HeJ mouse strains were assessed by quantitative real-time PCR(qPCR).Results The variation of expression levels was analyzed using geNorm program and demonstrated that GAPDH and HPRT1 were the most stable genes in different tissues at various developmental stages.PPIA,18S rRNA and ACTB were less stable,whereas B2M expression was almost undetectable in different tissues during development.Conclusions The successful selection of these two most stable housekeeping genes GAPDH and HPRT1 proves its necessity and feasibility,and provide the methodology for housekeeping gene selection as well.

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期刊信息
  • 《中国实验动物学报》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科协技术协会
  • 主办单位:中国实验动物学会 中国医学科学院医学实验动物研究所
  • 主编:秦川
  • 地址:北京市朝阳区潘家园南里5号
  • 邮编:100021
  • 邮箱:b6771337@126.com
  • 电话:010-67779337
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4847
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2986/Q
  • 邮发代号:2-748
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6376