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GmAGL15基因启动子的克隆及序列分析
  • ISSN号:1000-9841
  • 期刊名称:《大豆科学》
  • 时间:0
  • 分类:S565.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学国家大豆改良中心,作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30771362);国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2006AA1021C1);教育部高等学校引智计划(111计划)资助项目(B08025).
中文摘要:

为探明大豆GmAGL15基因的表达调控规律,应用电子克隆技术从大豆基因组中克隆了GmAGL15 1000bp的启动子序列,用PLACE在线启动子预测工具分析表明:该序列含有启动子的一般结构,如TATA-BOX、CAAT-BOX。另外还含有一些顺式作用元件,如调控GmAGL15的组织特异的和特定发育阶段的表达,对胁迫的应答,对光的响应,以及反馈调节,推测大豆GmAGL15基因表达有相应组织特异性,可能受蔗糖、生长素和乙烯等的调控。用FootPrinter和PLACE在线工具对大豆与拟南芥等其他4种植物的同源基因启动子的顺式元件进行比较,发现不同植物的启动子既有保守性,又有多样性,转录因子结合位点的分布相似,但也有区别,暗示了GmAGL15基因表达调控的精确性或多样性。

英文摘要:

In order to study GmAGL15 gene expression and regulation in soybean,its1000 bp promoter sequence was cloned from the soybean genome in silico. Promoter sequence analyzed by PLACE showed that it had TATA-box, CAAT-box and some cis-acting elements which could regulate specific expression in different organs and response to stresses, light, and self-feedback. In addition, GmAGL15 may be regulated by sucrose, auxin and ethylene. Comparaison of the promoter of GmAGL15 with homologues from other plants by FootPrinter and PLACE suggested that these promoters had conserved and diverse domains, while the distribution of transcription factor-binding sites had similarity and difference. These findings implied the accuracy and diversity of GmAGL15 gene expression and regulation.

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期刊信息
  • 《大豆科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江农业科学院
  • 主办单位:黑龙江省农业科学院编辑出版中心
  • 主编:刘忠堂
  • 地址:哈尔滨市南岗区学府路368号
  • 邮编:150086
  • 邮箱:dadoukx@sina.com
  • 电话:0451-86668735
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-9841
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1227/S
  • 邮发代号:14-95
  • 获奖情况:
  • 1988年获黑龙江优秀期刊奖,1996年获黑龙江省科技情报二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:12334