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COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试
  • ISSN号:1672-6472
  • 期刊名称:《菌物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q523.03[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室,北京100101, [2]鲁东大学菌物科学与技术研究院山东省食用菌技术重点实验室,山东烟台264025
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.31070015); 中国科学院知识创新工程项目(No.KSCX2-EW-J-6)
中文摘要:

以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。

英文摘要:

COI gene was tested with 76 strains of 33 species of the nectriaceous fungi to investigate its feasibility of serving as a DNA barcode.The results indicated that introns are present in some species,which made it difficult for PCR amplification and sequencing.COI gene is not a good DNA barcode for this group.Analysis of the obtained COI sequences showed that this gene may have the capacity to distinguish species of the nectriaceous fungi.

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期刊信息
  • 《菌物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国菌物学会
  • 主编:戴玉成
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
  • 邮编:100101
  • 邮箱:jwxt@im.ac.cn
  • 电话:010-64807521
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6472
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5180/Q
  • 邮发代号:2-499
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5637