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子囊菌部分类群DNA条形码的选择与评价
  • 项目名称:子囊菌部分类群DNA条形码的选择与评价
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31070015
  • 申请代码:C010103
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:庄文颖
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院微生物研究所
  • 批准年度:2010
中文摘要:

生物进化的复杂性使人类快速准确地识别自然界的物种面临着挑战。条形码技术是在计算机的应用实践中产生和发展起来的一种自动识别技术,在现代商品销售业中起着举足轻重的作用。在分类学方面,基于DNA四种碱基位点的变化,结合发达的网络信息技术而建立的生物物种DNA条形码(DNA Barcode)已成为目前生物多样性领域的前沿科学问题之一。该技术首先尝试性地用于动物的物种鉴别,以真菌为材料的研究刚刚起步。本项目拟利用项目组长期以来对子囊菌部分类群进行分类和分子系统学研究的积累,以及中国科学院微生物所丰富的真菌标本和菌种资源,对子囊菌几个不同类群DNA条形码特定基因片段进行选择,并对它们作出评价,为逐步建立中国真菌DNA条形码数据库提供基础数据和经验,为丰富国际DNA条形码数据库出一份力。其结果将有助于各类真菌的简便、准确、快速识别,加速真菌资源的开发利用,促进真菌保护生物学、生物多样性及系统演化研究。

结论摘要:

在北京、安徽、河南、四川、青海等地自然保护区进行野外子囊菌资源考察,采集标本500余份,对其中部分类群的材料进行分离培养,获得活菌株,为分类、分子系统学研究与DNA条形码筛选提供实验材料。以丛赤壳科、新从赤壳属、木霉属、粒毛盘菌属等子囊菌类群为研究材料,选取CO1、?-tubulin、RPB2、EF-1α、ITS、LSU、EF3、Hsp90、AAC、CDC48等为条形码候选基因片段,删选出上述类群的条形码片段。探索、熟练掌握并建立了一套从干标本和培养物成功提取总DNA、引物设计、PCR扩增、序列分析到条形码筛选和评价的方法。同时,探讨了上述类群的系统发育关系,并用RNA二级结构序列分析方法探讨了子囊主要类型的系统发育规律。项目执行期间,发表署名基金资助项目编号31070015的论文18篇(部分为共同资助),其中SCI收录刊物中8篇。发表真菌新属1个、新种15个,报道中国新记录种8个。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 26
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
期刊论文
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