农民专业合作组织的发展对推进新农村建设具有重要意义。现实中,农民合作组织发展仍然面临较多的问题,湖南作为全国农民专业合作组织建设的试点省份,其合作组织的数量在全国排名靠前,但就合作组织发展的质量而言,在全国并无优势。合作组织发展的好坏在很大程度上取决于其内部组织制度建设。为此,本文利用对江苏省肉鸡行业合作社实际调研的数据,实证分析农民专业合作组织的绩效与内部运行机制的关系,并以此为鉴,提出深化湖南省农民专业合作组织的五阶段论。