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海藻糖抑制淀粉质多肽42构象转变的分子动力学模拟
  • ISSN号:1000-6818
  • 期刊名称:《物理化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]天津大学化工学院生物工程系,天津300072
  • 相关基金:国家自然科学基金(20636040 20876111 20906068); 国家重点基础研究发展规划项目(973)(2009CB724705); 天津市科委自然科学重点基金(08JCZDJC17100)资助
中文摘要:

应用分子动力学模拟方法研究了海藻糖抑制淀粉质多肽42(Aβ42)构象转变的分子机理.结果表明,海藻糖溶液浓度对Aβ42构象转变具有非常重要的影响.在水和低浓度海藻糖溶液(0.18mol·L-1)中,Aβ42可由初始的α-螺旋结构转变成β-折叠的二级结构;但海藻糖浓度为0.37mol·L-1时即可有效抑制Aβ42的构象转变.这是因为海藻糖利用其优先排阻作用使水分子在多肽周围0.2nm内富集,而其自身却在距离多肽0.4nm的位置附近团聚.另外,海藻糖还可通过降低多肽间的疏水相互作用,减少多肽分子内远距离的接触,有效抑制多肽的疏水塌缩和构象转变.上述分子模拟的结果对于进一步合理设计阿尔茨海默病的高效抑制剂具有非常重要的理论指导意义.

英文摘要:

The molecular mechanism of the conformational transition of amyloid peptide 42(Aβ42) inhibited by trehalose was studied using molecular dynamics simulation.It is confirmed that the conformational transition of Aβ42 is prevented by trehalose in a dose-dependent manner.In water and low-concentration trehalose(0.18 mol·L-1) solutions,Aβ42 transforms from its initial α-helix to a β-sheet.In 0.37 mol·L-1 trehalose,however,the conformational transition of Aβ42 is prevented.It is obvious that there is a hydration shell within about 0.2 nm from the closest atoms of Aβ42 on the peptide surface,which is caused by the preferential exclusion of trehalose.Trehalose molecules cluster around the peptide at a distance of 0.4 nm.In addition,the intra-peptide hydrophobic interactions are weakened and the number of long range contacts of Aβ42 is decreased by trehalose.Therefore,the hydrophobic collapse of the peptide is alleviated and the conformational transition is inhibited.These findings are important for the rational design of a highly efficient inhibitor for Alzheimer's disease.

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期刊信息
  • 《物理化学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:北京大学化学与分子工程学院承办
  • 主编:刘忠范
  • 地址:北京大学化学楼
  • 邮编:100871
  • 邮箱:whxb@pku.edu.cn
  • 电话:010-62751724
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6818
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1892/O6
  • 邮发代号:82-163
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
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