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过表达Daintain促进RAW264.7细胞增殖和吞饮功能
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:R34[医药卫生—基础医学] Q756[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]海南医学院理学院生化与分子生物学教研室,海南海口571199, [2]海南医学院理学院生物技术专业实验室,海南海口571199, [3]华中科技大学生命科学与技术学院,湖北武汉430074
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(81460558,81172511);海南医学院人才引进科研启动经费(2013005)
中文摘要:

目的:探讨人Daintain基因5’调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TFSEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点。结果:人Daintain基因5’调控区存在1个CAAT盒。Daintain基因可能存在6个启动子位点,CpG岛可能位于216bp区间(23~238bp)。评分85分以上时,该序列存在251个可能的转录因子结合位点;评分90分以上时,该序列存在70个可能的转录因子结合位点;评分95分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100分以上时,该序列存在7个可能的转录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论:人Daintain基因5’调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础。

英文摘要:

Objective: To investigate the sequence characteristics of human Daintain gene 5' regulatory region. Methods: The pro- moter region, distribution of CpG island and transcriptional binding sites of human Daintain gene were predicted by online software such as BLAST, Neural Network Promoter Prediction, Promoter 2.0, Promoter SCAN, EMBOSS, CpG Island Searcher and TF SEARCH. Results: The 5' regulatory region of Daintain gene contained a CAAT box. The Daintain gene may contained 6 promoter regions, a 216 bp (23 - 238 bp) CpG island. 251 potential transcription factors binding sites were predicted in the 5' regulatory region of Daintain gene when the score higher than 85 scores; 70 potential transcription factors binding sites were predicted when the score higher than 90 scores; 16 potential transcription factors binding sites were predicted when the score higher than 95 scores; 7 potential transcription factors bind- ing sites were predicted when the score higher than 100 scores. A majority of potential transcription factors were associated with im- munocyte proliferation and sex determination. Conclusion: Research by bioinformatics technology suggested that the transcription of Daintain gene was regulated by DNA methylation and many transcription factors, and provided information for the study on the promoter of Daintain gene.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503