位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
SSB蛋白与ssDNA相互作用的动力学和可视化研究
  • ISSN号:1000-6737
  • 期刊名称:《生物物理学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中英昆虫生物学联合实验室,南阳师范学院,南阳473061, [2]中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台,北京100101
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30500097);
中文摘要:

研究大肠杆菌单链结合蛋白(single-stranded DNA-binding protein,SSB)与单链DNA(single-stranded DNA,ssDNA)的相互作用对于了解其在DNA复制、重组和修复中的作用是非常重要的。通过表面等离子共振技术(surface plasmon resonance,SPR)得到了在有、无镁离子的情况下,SSB与ssDNA两者的平衡解离常数(equilibrium dissociation constant,KD)分别为9.67×10^-7M和4.79×10^-7M,阐明了镁离子对于两者作用形式的影响。利用原子力显微镜技术分别观察SSB蛋白、ssDNA和SSB-ssDNA复合物的成像,为下一步研究SSB在DNA代谢中作用模式的单分子可视化奠定了基础。

英文摘要:

Study of interaction of E. coli single-stranded DNA-binding protein (SSB) with its substrate, single-stranded DNA (ssDNA), is very important for understanding its essential roles in replication, recombination and repair of DNA. In this report, interaction of SSB with ssDNA was monitored by surface plasmon resonance (SPR) and directly observed using atomic force microscopy (AFM), which presented an attempt to investigate the binding mode of SSB by a single-molecule visualization methodology. The resulting SSB protein was a correctly folded tetramer with an apparent binding to 43-mer ssDNA with the equilibrium dissociation constant (KD) of 9.67×10^-7 M and 4.79×10^-7 M respectively whether MgCl2 was present or not as determined by SPR. In the AFM images, individual ssDNA, SSB protein and SSB-ssDNA complex were visualized. The used ssDNA was long enough for cooperative SSB binding and the authors observed that SSB protein distributed on ssDNA non-specifically.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《生物物理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国生物物理学会
  • 主编:沈恂
  • 地址:北京朝阳区大屯路15号生物物理研究所内
  • 邮编:100101
  • 邮箱:acta@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888458
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6737
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1992/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 二次获得中国科协优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:7189