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SSB蛋白的高效表达及其与ssDNA的相互作用
  • ISSN号:1671-8135
  • 期刊名称:《中国生物工程杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中英昆虫生物学联合实验室,南阳师范学院,南阳473061, [2]中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台,北京100101
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30500097).
中文摘要:

大肠杆菌单链结合蛋白SSB在DNA复制、重组和修复中起着重要作用。为研究单链结合蛋白SSB的体外生物功能构建了融合蛋白SSB的表达载体并使其高效表达及易于纯化。ssb基因片段是以E.coliK-12基因组为模板经PCR扩增获得,并通过基因的体外拼接成功构建了表达载体pQE30-ssb。重组菌株M15/pQE30-ssb经过IPTG的诱导表达了蛋白SSB。收集菌体细胞、超声波破碎后离心取上清进行SDS-PAGE分析,结果表明有一与预期分子量(20.6kDa)相应的诱导表达条带出现,其表达量约占全细胞蛋白的30%且以可溶形式存在。利用固定化金属离子(Ni^2+)配体亲和层析柱纯化融合蛋白SSB,其纯度达到90%。通过凝胶层析和等离子共振技术对SSB的生物功能进行了系统研究分析。结果表明,SSB蛋白以四聚体形式与单链DNA分子结合,其亲和力常数(KD)为4.79×10^-7mol/L。

英文摘要:

E. coli single- stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in replication, recombination and repair of DNA and is thus crucial for the survival of the bacteria. We described a high expression and efficient purification scheme and kinetic assay of interaction with its substrate, single-stranded DNA (ssDNA). A ssb gene (537 bp) for encoding SSB was obtained by PCR amplification from E. coli K-12 genome. The expression vector of the fusion protein SSB was constructed by attaching ssb gene to pQE30. SSB fusion protein was expressed in M15 E. coli strain induced by IPTG. SDS-PAGE analysis revealed that the expected protein with a molecular weight 20. 6kDa was soluble and amounted to about 30% of the total bacterial protein. SSB protein was purified by immobilized metal ( Ni^2+ ) chelation affinity chromatography and the purity was about 90%. The resulting SSB protein was a correctly folded tetramer analyzed by gel filtration. It could bind ssDNA with equilibrium dissociation constant (KD ) of 4. 79 × 10^-7 mol/L as determined by surface plasmon resonance.

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期刊信息
  • 《中国生物工程杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院文献情报中心 中国生物技术发展中心 中国生物工程学会
  • 主编:张树庸
  • 地址:北京市中关村北四环西路33号
  • 邮编:100080
  • 邮箱:biotech@mail.las.ac.cn
  • 电话:010-82624544 82626611-6631
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-8135
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4816/Q
  • 邮发代号:82-673
  • 获奖情况:
  • 1991年中国科学院科技进步三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12959