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ISTR在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:《园艺学报》
  • 时间:0
  • 分类:S665.2[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室,武汉430070, [2]山西运城学院生命科学系,山西运城044000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30471203);华中农业大学科研启动基金项目(52204-06052)
中文摘要:

利用反向序列标签重复技术(inverse sequence-tagged repeat,ISTR),对柿属7个种,包括柿(Dios Fyroskaki Thunb.)、君迁子(D.lotus L.)、浙江柿(D.glaucifoliaMetc.)、油柿(D.oleifera Cheng.)、金枣柿(D.sp.)、老鸦柿(D.rhombifolia Hemsl.)和美洲柿(D.virginiana L.)共32个基因型进行了种质鉴定和亲缘关系研究。结果表明:ISTR可区分供试柿属植物中的30份;ISTR能够很好地适用于柿属植物亲缘关系分析;供试的中国与日本原产柿种质分别聚类;新发现的中国甜柿变异类型与日本甜柿的亲缘关系较远且存在较丰富的遗传变异,可能是潜在的育种资源。ISTR标记可在柿属植物种质资源鉴定和亲缘关系分析中更广泛地应用。

英文摘要:

Inverse sequence-tagged repeat (ISTR) molecular marker was employed to investigate genetic relationships of 32 genotypes representative of 7 species including Diospyros katki Thunb. , D. lotus L. , D. glaucifolia Metc. , D. oleifera Cheng. , Jinzaoshi (D. sp. ), D. rhombifolia I-Iemsl. and D. virginiana L. ISTR showed good discriminatory power between genotypes, with exception of one bud mutation and its original variety. The clustering results derived from ISTR molecular data was in good agreement with the previous studies or known genetic relationships of some genotypes, indicating that ISTR could be applied for the genus of Diospyros. Both unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA) and principal coordinated analysis (PCOA) results separated Japanese persimmon into different groups, indicating their different genetic background. The new found several Chinese native PCNA varieties showed abundant genetic diversity based on ISTR analysis, as well as with Japanese native PCNA types, suggesting that they may be potential and precious breeding materials. In summary, ISTR would be a potential efficient tool for further germplasm differentiation, genetic diversity assessment and phylogenetic analysis in Diospyros.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371