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猪羰基还原酶1(CBR1)基因克隆及组织表达谱分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S813.3[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医] Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]广东第二师范学院生物与食品工程学院/广东高校应用生态工程技术开发中心,广东广州510303, [2]华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室,广东广州510642, [3]广东温氏食品集团股份有限公司,广东云浮527400
  • 相关基金:国家自然科学基金(31201771); 国家科技支撑计划项目(2011BAD28B01); 国家现代农业产业技术体系专项(CARS-36)
中文摘要:

为了深入研究猪羰基还原酶1(CBR1)基因的表达调控,通过PCR获得包括猪CBR1基因启动子和外显子、内含子的序列,并进行蛋白结构分析和系统进化关系比较,通过RT-PCR方法检测了CBR1基因在不同组织的表达丰度。结果表明,猪CBR1基因启动子区长度为2 875 bp,具有潜在典型的NFκB等转录因子结合位点;CBR1基因由3个外显子和2个内含子组成,外显子长度分别为289、108和437 bp,其中5′UTR和3′UTR分别为107 bp和242 bp,内含子长度分别为572 bp和3 219 bp,编码区由289个氨基酸组成;该蛋白为亲水性蛋白,无明显的信号肽,有2个跨膜区域;蛋白二级结构和三级结构主要由7个α-螺旋、7个β-折叠以及loop环构成。猪CBR1基因氨基酸序列与人、绵羊氨基酸的相似性较高,为84.48%。q RT-PCR结果表明,怀孕12 d的二花脸子宫内膜中CBR1基因m RNA的表达量极显著高于长大二元母猪;在怀孕12 d母猪9个组织中,CBR1在肾脏中的表达量最高,其次是肝脏和小肠。

英文摘要:

The promoter, exons and introns of porcine carbonyl reductasel gene ( CBR1 ) were cloned, and the structure of CBR1 protein was analyzed. The similarity of amino acid was compared with other species and the phylogen of the gene was constructed. The tissues expression of the gene was detected by RT-PCR. The results showed that the promoter of the gene contained 2 875 bp, and typical binding sites of NF K B were predicted. The gene included three exons and two introns, and the formers spanned 289, 108 and 437 bp, respectively. The two introns spanned 572 bp and 3 219 bp, respectively. The 5' UTR of 107 bp and 3' UTR of 242 bp were identified. The CDS was encoded by 289 amino acids. The CBR1 protein was hydrophilic, and contained two transmemhrane domains but no signal peptide was found. The tertiary structure of the protein was formed by seven α -helixes, seven sheets, and loops. The amino acid sequence of the gene exhibited higher similarity of 84.48% with that of human and sheep. The CBR1 mRNA in the endometrium of Erhualian sows was higher significantly than that of Landrace × large white sows on GD12 ( gestation day 12 ) ( P〈0.01 ) . The gene was expressed with the highest level in kidney tissue and the higher in liver and small bowel tissues of Erhualian on GD12.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995