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用广义选择性神经网络集成预测MHC—Ⅱ分子结合肽
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:《计算机工程与应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP301.06[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]广东商学院数学与计算科学系,广州510320
  • 相关基金:国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60574078)广东省自然科学基金:(the Natural Science Foundation of Guangdong Province of China under Grant No.06301003)
作者: 胡桂武[1]
中文摘要:

MHCⅡ类分子结合肽的预测对于免疫研究和疫苗设计非常重要,然而其结合肽长度的可变性等原因使其预测变得极为困难,提出了一种基于广义选择性神经网络集成的MHCⅡ分子结合肽预测算法,该算法是一种双层集成模型。第一层是用微分进化算法去生成初始神经网络集成池,第二层是从初始神经网络集成池中选择部分组成最终的神经网络集成。实验结果表明广义选择性神经网络集成比传统的选择性神经网络有更好的泛化性能。

英文摘要:

Predictions of the binding ability of antigen peptides to Major Histocompatibility Complex(MHC) class II molecules are important for immunology research and vaccine design.The variable length and other aspects of each binding peptide complicate this prediction.In this paper,generalized selective neural network ensemble is proposed for prediction of MHC class II-bind- ing peptides,the ensemble is built on two-level ensemble architecture.The first-level ensemble is used to create primary Neural Network Ensemble(NNE),where differential evolution is used to build some NNEs.The second-level ensemble is that a subset of primary NNEs is selected to make up the final ensemble.Experiment results indicate that the generalized ensemble model has better generalization and performance compared to traditional selective neural network ensemble.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编:怀进鹏
  • 地址:北京市海淀区北四环中路211号北京619信箱26分箱
  • 邮编:100083
  • 邮箱:ceaj@vip.163.com
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-8331
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2127/TP
  • 邮发代号:82-605
  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:97887