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苹果砧木珠眉海棠盐胁迫应答基因的微列阵研究
  • ISSN号:1007-4333
  • 期刊名称:中国农业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:61-67
  • 语言:中文
  • 分类:S611.1[农业科学—园艺学] S601[农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]中国农业大学农学与生物技术学院,北京100193
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30600416);北京市自然科学基金资助项目(5072027)
  • 相关项目:苹果属植物盐应答基因的克隆和功能分析
中文摘要:

以盐胁迫下苹果的耐盐砧木珠眉海棠为材料,用SMART^TM方法构建了eDNA文库。随机挑取5000个cDNA克隆制备芯片,得到差异表达的基因388个,其中249个表达上调、139个表达下调。分析其中变化量在8倍以上的42个基因,并对部分基因进行RT—PCR验证,结果与芯片杂交结果一致。根据功能把这些基因分为5类:光合作用相关基因、物质转运相关基因、基础代谢相关基因、逆境相关基因以及其他基因。其中直接参与盐应答的基因占34%,包括上游调控蛋白、合成植体内小分子渗透调节物的限速酶、胁迫产生的活性氧清除剂、直接调节离子运输和储存的蛋白等。用此cDNA微列阵体系,将基因芯片技术与cDNA文库相结合,成为全面研究盐胁迫下基因表达的有效途径。为进一步研究盐应答基因功能及盐胁迫机制提供参考。

英文摘要:

A cDNA library was constructed in Malus zumi Mats under salt stress by SMARTTM . 5 000 cDNA clones were randomly selected for microarray analysis. 388 genes were identified responding to salt stress,among which 249 genes were up-regulated and 139 genes down-regulated. 42 genes,whose expression changed more than 8 folds under salt stress were sequenced. 4 genes selcted for RT-PCR analysis showed similar expression pattern with microarry. The 42 genes can be classified into 5 groups: photosynthesis-related genes, transport-related genes, metabolism-related genes, stress-related genes and the others genes. The results showed that salt stress influenced many aspects of plant growth in M. zumi Mats~ some of these genes may play important roles in plant salt tolerance. Our findings may result in further functional study of salt-response genes in M. zumi Mats and the elucidation of its molecular mechanism of response, to salt stress.

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期刊信息
  • 《中国农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:李保国
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号
  • 邮编:100094
  • 邮箱:xuebao@cau.edu.cn
  • 电话:010-62732619
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-4333
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3837/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21575