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小金海棠S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(MxSAMS)的克隆和表达分析
  • ISSN号:1006-1304
  • 期刊名称:农业生物技术学报
  • 时间:0
  • 页码:121-125
  • 语言:中文
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]中国农业大学园艺植物研究所/北京市果树逆境生理与分子生物学重点实验室,100193
  • 相关基金:圉家高技术研究与发展规划(863)(No.2006AA102186)、国家自然科学基金(No.30671441)和博士点基金(No.20050019148)资助.
  • 相关项目:苹果属植物盐应答基因的克隆和功能分析
中文摘要:

从本实验室建立的小金海棠缺铁差减文库中分离出一个cDNA片段,在GenBank中发现该片段与其它植物的S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因具有90%的同源性。利用RACE技术成功地获得小金海棠(Malus xiaojinensis)SAMS基因(MxSAMS)的cDNA全长序列(GenBank登录号:EU639408),该基因cDNA全长1479bp,最大开放阅读框1176bp,编码392个氨基酸,酶蛋白理论分子量为42.99kD;与其它植物的蛋白质氨基酸序列同源性在88.1%-92.6%之间。推测的MxSAMS蛋白质三级结构包含3个保守结构域和一个保守的ATP结合位点GAGDQG。Southern杂交显示,MxSAMS基因在小金海棠基因组中是单拷贝的。半定量RT-PCR结果表明,该基因在小金海棠的根和叶中均受缺铁胁迫诱导增强表达。

英文摘要:

S-adenosylmethionine synthetase gene (SAMS) cDNA from an iron-deficiency subtracted library of Malus xiaojinensis was isolated ,and showed 90% identity to the other homolog gene of S-adenolyl-L-methionine synthetase enzyme in GenBank. The full length cDNA of SAMS gene from M. xiaojinensis was obtained using RACE and named as MxSAMS (GenBank accession No. EU639408). The full cDNA of MxSAMS was 1479 bp with a complete open reading frame of 1176 bp that encoded a predicted polypeptide of 392 amino acids with the predicted MW of 42.99 kD. MxSAMS showed 88.1%-92.6% amino acids sequence similarity with the other SAMS in plant. The deduced product of MxSAMS had the conserved domain among all the known SAMS, including a ATP binding domain. Southern blot showed that there was only one single copy of MxSAMS gene in the genome. The result of semiquantitative RT-PCR indicated that the MxSAMS could be induced and expressed by iron-deficiency stress in root and leaves of M.xiaojinensis .

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