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三年生白木香机械伤害转录组学研究
  • ISSN号:0513-4870
  • 期刊名称:药学学报
  • 时间:2012.8.12
  • 页码:1106-1110
  • 分类:R931[医药卫生—生药学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院, [2]北京协和医学院药用植物研究所,北京100193, [3]中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所, [4]海南省南药资源保护与开发重点实验室,海南万宁571533
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助项目(31100220,31000136,81173539);“十二五”国家科技支撑计划项目(2011BAl01807)
  • 相关项目:白木香倍半萜合酶基因转录调控元件的克隆及其与转录因子结合特性分析
中文摘要:

3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是萜类合成甲羟戊酸(MVA)途径中的第一个关键限速酶。本研究根据课题组白木香转录组数据库中的HMGR2部分转录本序列设计引物,利用RT-PCR和RACE技术克隆HMGR2基因的全长cDNA序列,并对其进行生物信息学分析;利用荧光定量PCR检测AsHMGR2基因在不同组织和不同伤害处理下的表达差异。克隆得到的白木香AsHMGR2基因开放阅读框为1749bp,编码582个氨基酸,GenBank登录号为KCl40287。组织表达分析的结果显示,AsHMGR2基因主要在根和茎尖中表达,其次是主干,叶中的表达量最低;该基因同时受物理伤害和结香液处理的诱导,分别在6h和8h达到最高表达水平。本研究通过AsHMGR2基因的全长cDNA克隆和表达特性分析,为后续深入研究其在沉香倍半萜合成途径的功能奠定了基础。

英文摘要:

3-Hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase (HMGR) is the first rate-limiting enzyme for sesquiterpene synthesis in the mevalonate (MVA) pathway. The specific primers were designed according to the transcript sequence of AsHMGR2 from the Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg transcriptome database. The full- length cDNA of AsHMGR2 was cloned by RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends (RACE) technology, and was analyzed at bioinformatics levels; AsHMGR2 different treatments were analyzed by real-time PCR. expression profiles in different tissues and in responds to The length of AsHMGR2 Open Reading Frame (ORF) was 1 749 bp, encoding 582 amino acids. The GenBank accession number is KC140287. Tissue expression analysis indicated that AsHMGR2 was mainly expressed in root and shoot tips, followed by stem, and was lowest in leaves. Inducible-experiments showed that the genes were induced by mechanical wound as well as chemical liquid induction, and reached the highest expression level at 6 h and 8 h, separately. The full-length cDNA of AsHMGR2 and its expression patterns will provide a foundation for further research on its function in agarwood sesquiterpene biosynthesis.

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期刊信息
  • 《药学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会 中国药学科学院药物研究所
  • 主编:王晓良
  • 地址:北京市先农坛街1号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:yxxb@imm.ac.cn
  • 电话:010-63026192
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-4870
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2163/R
  • 邮发代号:2-233
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双高”期刊,2002年为第2届国家期刊奖百种重点科技期刊并获第3...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37721