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广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析
  • ISSN号:2095-1191
  • 期刊名称:《南方农业学报》
  • 时间:0
  • 分类:S828.89[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]广西畜牧研究所/广西家畜遗传改良重点实验室,南宁530001, [2]广西大学动物繁殖研究所/亚热带生物资源保护利用国家重点实验室,南宁530005
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31360544);广西家畜遗传改良重点实验室开放基金项目(2013GXKFKT-08)
中文摘要:

[目的]克隆广西德保猪抵抗素(Resistin,RENT)基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制.[方法]根据NCBI已公布的猪RENT基因序列(NM 213783.2)设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析.[结果]扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列.多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0%、85.5%、85.5%、84.5%、81.2%、80.3%、80.0%和77.3%.德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲.[结论]RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因.

英文摘要:

[Objective] Cloning and bioinformatics analysis of Resistin gene in Debao pig were conducted to explore molecular mechanism of adipocyte differentiation and lipogenesis of Debao pig.[Method]With the released pig RENT gene sequence(NM_213783.2) as a template,a pair of primers was designed.The RENT gene was amplified by RTPCR from isolated total RNA of Debao pig blood.The RENT gene was inserted into pEASY-T1 vector by T-A clone method,and was sequenced.And its bioinformatics analysis was performed using BLAST program,MEGA5.0 software,EXPASY server,SMART program,SignIP program,Softberry server and DNAStar program.[Result]A 468bp RENT gene fragment of Debao pig was cloned and sequenced.The sequence multi-aligned results showed that Debao pig RENT gene shared 100.0%,85.5%,85.5%,84.5%,81.2%,80.3%,80.0% and 77.3% homology with that of Sus scrofa,Bos taurus,Capra hircus,Ovis aries,Homo sapiens,Oryctolagus cuniculus,Macaca mulatta and Cavia porcellus,respectively.The further protein structure bioinformatics analysis suggested that it was a weakly basic protein with the weight of 11.69 ku and isoelectric point of 7.82.It had an N-terminal signal peptide,localized in the extranuclear with a low complexity domain containing 1α-helices,8 β-folds,7 T-corners and 2 random coils.[Conclusion]Resistin gene fragment in Debao pig is highly conserved in multiple species,and it is of great importance in controlling adipose cell differentiation of Debao pig.

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期刊信息
  • 《南方农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:广西壮族自治区农业科学院
  • 主办单位:广西壮族自治区农业科学院
  • 主编:李杨瑞
  • 地址:南宁市大学东路174号
  • 邮编:530007
  • 邮箱:nfnyxb@163.com
  • 电话:0771-3240518
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1191
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1381/S
  • 邮发代号:48-3
  • 获奖情况:
  • 第六届广西十佳自然科学期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘
  • 被引量:5649